RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP4C-208ENST00000564966 ILDR2Q71H61 639 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP4C-208ENST00000564966 ALKQ9UM73 1620 aa38.49■■■■□ 3.75
PPP4C-208ENST00000564966 RIMS2Q9UQ26 1411 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP4C-208ENST00000564966 KCNA6P17658 529 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.45■■■■□ 3.75
PPP4C-208ENST00000564966 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 ZFYVE9O95405 1425 aa38.42■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM94Q12767 1356 aa38.41■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa38.39■■■■□ 3.74
PPP4C-208ENST00000564966 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
PPP4C-208ENST00000564966 NWD1Q149M9 1564 aa38.28■■■■□ 3.72
PPP4C-208ENST00000564966 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
PPP4C-208ENST00000564966 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.26■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 NAIPQ13075 1403 aa38.25■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM52Q96A61 297 aa38.25■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 TBX22Q9Y458 520 aa38.24■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 SOCS7O14512 581 aa38.23■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 MSH6P52701 1360 aa38.22■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP38.2■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 C14orf37Q86TY3 774 aa38.2■■■■□ 3.71
PPP4C-208ENST00000564966 FAM135BQ49AJ0 1406 aa38.15■■■■□ 3.7
PPP4C-208ENST00000564966 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa38.15■■■■□ 3.7
PPP4C-208ENST00000564966 DIP2AQ14689 1571 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP4C-208ENST00000564966 HFM1A2PYH4 1435 aa38.12■■■■□ 3.69
PPP4C-208ENST00000564966 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa38.11■■■■□ 3.69
PPP4C-208ENST00000564966 TRPM2O94759 1503 aa38.09■■■■□ 3.69
PPP4C-208ENST00000564966 CLTCL1P53675 1640 aa38.08■■■■□ 3.69
PPP4C-208ENST00000564966 PIK3R4Q99570 1358 aa38.07■■■■□ 3.69
PPP4C-208ENST00000564966 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
PPP4C-208ENST00000564966 SLAIN2Q9P270 581 aa38.06■■■■□ 3.68
PPP4C-208ENST00000564966 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa38.05■■■■□ 3.68
PPP4C-208ENST00000564966 KIF1BO60333 1816 aa38.01■■■■□ 3.67
PPP4C-208ENST00000564966 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa37.98■■■■□ 3.67
PPP4C-208ENST00000564966 ATF3P18847 181 aa37.98■■■■□ 3.67
PPP4C-208ENST00000564966 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.96■■■■□ 3.67
PPP4C-208ENST00000564966 PTPRUQ92729 1446 aa37.95■■■■□ 3.67
PPP4C-208ENST00000564966 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.94■■■■□ 3.66
PPP4C-208ENST00000564966 CADPS2Q86UW7 1296 aa37.94■■■■□ 3.66
PPP4C-208ENST00000564966 C19orf44Q9H6X5 657 aa37.94■■■■□ 3.66
PPP4C-208ENST00000564966 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.93■■■■□ 3.66
PPP4C-208ENST00000564966 PHLPP1O60346 1717 aa37.9■■■■□ 3.66
PPP4C-208ENST00000564966 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
PPP4C-208ENST00000564966 METP08581 1390 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP4C-208ENST00000564966 FOXD1Q16676 465 aa37.87■■■■□ 3.65
PPP4C-208ENST00000564966 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
PPP4C-208ENST00000564966 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
PPP4C-208ENST00000564966 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.77■■■■□ 3.64
PPP4C-208ENST00000564966 JCADQ9P266 1359 aa37.77■■■■□ 3.64
PPP4C-208ENST00000564966 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.75■■■■□ 3.63
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.74■■■■□ 3.63
PPP4C-208ENST00000564966 DCCP43146 1447 aa37.71■■■■□ 3.63
PPP4C-208ENST00000564966 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PPP4C-208ENST00000564966 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PPP4C-208ENST00000564966 RGL3Q3MIN7 710 aa37.7■■■■□ 3.63
PPP4C-208ENST00000564966 BRINP3Q76B58 766 aa37.69■■■■□ 3.62
PPP4C-208ENST00000564966 PPLO60437 1756 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4C-208ENST00000564966 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.66■■■■□ 3.62
PPP4C-208ENST00000564966 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
PPP4C-208ENST00000564966 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 MST1RQ04912 1400 aa37.62■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.61■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.61■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.6■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 PTCH1Q13635 1447 aa37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 ROBO2Q9HCK4 1378 aa37.57■■■■□ 3.61
PPP4C-208ENST00000564966 POTEAQ6S8J7 498 aa37.57■■■■□ 3.6
PPP4C-208ENST00000564966 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.56■■■■□ 3.6
PPP4C-208ENST00000564966 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PPP4C-208ENST00000564966 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PPP4C-208ENST00000564966 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
PPP4C-208ENST00000564966 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.52■■■■□ 3.6
PPP4C-208ENST00000564966 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.51■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 SHPRHQ149N8 1683 aa37.5■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 STK26Q9P289 416 aa37.5■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 LRP6O75581 1613 aa37.49■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.48■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.46■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.45■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
PPP4C-208ENST00000564966 IFT172Q9UG01 1749 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-208ENST00000564966 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.4■■■■□ 3.58
PPP4C-208ENST00000564966 ORAI2Q96SN7 254 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
PPP4C-208ENST00000564966 PIK3C2GO75747 1445 aa37.35■■■■□ 3.57
PPP4C-208ENST00000564966 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
PPP4C-208ENST00000564966 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.34■■■■□ 3.57
PPP4C-208ENST00000564966 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms