RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555770.1

CKB-214, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 4

Gene CKB, Length 816 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-214ENST00000555770 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
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CKB-214ENST00000555770 BCANQ96GW7 911 aa40.98■■■■■ 4.15
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CKB-214ENST00000555770 POTEAQ6S8J7 498 aa40.97■■■■■ 4.15
CKB-214ENST00000555770 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.97■■■■■ 4.15
CKB-214ENST00000555770 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.95■■■■■ 4.15
CKB-214ENST00000555770 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
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CKB-214ENST00000555770 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
CKB-214ENST00000555770 TBX22Q9Y458 520 aa40.82■■■■■ 4.13
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CKB-214ENST00000555770 DIP2AQ14689 1571 aa40.7■■■■■ 4.11
CKB-214ENST00000555770 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CKB-214ENST00000555770 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.67■■■■■ 4.1
CKB-214ENST00000555770 ROCK1Q13464 1354 aa40.67■■■■■ 4.1
CKB-214ENST00000555770 PIK3R4Q99570 1358 aa40.67■■■■■ 4.1
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CKB-214ENST00000555770 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.62■■■■■ 4.09
CKB-214ENST00000555770 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
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CKB-214ENST00000555770 PTPRUQ92729 1446 aa40.57■■■■■ 4.08
CKB-214ENST00000555770 ATF3P18847 181 aa40.56■■■■■ 4.08
CKB-214ENST00000555770 NUP155O75694 1391 aa40.55■■■■■ 4.08
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CKB-214ENST00000555770 SHPRHQ149N8 1683 aa40.52■■■■■ 4.08
CKB-214ENST00000555770 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.47■■■■■ 4.07
CKB-214ENST00000555770 BRINP3Q76B58 766 aa40.47■■■■■ 4.07
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CKB-214ENST00000555770 DCCP43146 1447 aa40.44■■■■■ 4.06
CKB-214ENST00000555770 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
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CKB-214ENST00000555770 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
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CKB-214ENST00000555770 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.37■■■■■ 4.05
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CKB-214ENST00000555770 METP08581 1390 aa40.34■■■■■ 4.05
CKB-214ENST00000555770 TRIM52Q96A61 297 aa40.33■■■■■ 4.05
CKB-214ENST00000555770 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.32■■■■■ 4.04
CKB-214ENST00000555770 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
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CKB-214ENST00000555770 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
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CKB-214ENST00000555770 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.24■■■■■ 4.03
CKB-214ENST00000555770 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.23■■■■■ 4.03
CKB-214ENST00000555770 CLTCL1P53675 1640 aa40.21■■■■■ 4.03
CKB-214ENST00000555770 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
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CKB-214ENST00000555770 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
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CKB-214ENST00000555770 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.13■■■■■ 4.02
CKB-214ENST00000555770 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.07■■■■■ 4
CKB-214ENST00000555770 C8orf37Q96NL8 207 aa40.06■■■■■ 4
CKB-214ENST00000555770 KIF1BO60333 1816 aa40.05■■■■■ 4
CKB-214ENST00000555770 PTCH1Q13635 1447 aa40.04■■■■■ 4
CKB-214ENST00000555770 LAMC1P11047 1609 aa40.02■■■■■ 4
CKB-214ENST00000555770 RGS12O14924 1447 aa40.02■■■■■ 4
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CKB-214ENST00000555770 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40■■■■□ 3.99
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CKB-214ENST00000555770 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
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CKB-214ENST00000555770 HFM1A2PYH4 1435 aa39.84■■■■□ 3.97
CKB-214ENST00000555770 PPLO60437 1756 aa39.82■■■■□ 3.96
CKB-214ENST00000555770 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
CKB-214ENST00000555770 USP21Q9UK80 565 aa39.78■■■■□ 3.96
CKB-214ENST00000555770 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
CKB-214ENST00000555770 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
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