RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MACROD1-208ENST00000545464 MSH6P52701 1360 aa38.05■■■■□ 3.68
MACROD1-208ENST00000545464 ADGRL2O95490 1459 aa38.03■■■■□ 3.68
MACROD1-208ENST00000545464 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.03■■■■□ 3.68
MACROD1-208ENST00000545464 POTEAQ6S8J7 498 aa38.02■■■■□ 3.68
MACROD1-208ENST00000545464 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
MACROD1-208ENST00000545464 SLAIN2Q9P270 581 aa38■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 NWD1Q149M9 1564 aa37.98■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.96■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.95■■■■□ 3.67
MACROD1-208ENST00000545464 ZFYVE9O95405 1425 aa37.94■■■■□ 3.66
MACROD1-208ENST00000545464 C14orf37Q86TY3 774 aa37.92■■■■□ 3.66
MACROD1-208ENST00000545464 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
MACROD1-208ENST00000545464 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.9■■■■□ 3.66
MACROD1-208ENST00000545464 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.88■■■■□ 3.66
MACROD1-208ENST00000545464 PHLPP1O60346 1717 aa37.87■■■■□ 3.65
MACROD1-208ENST00000545464 TBX22Q9Y458 520 aa37.86■■■■□ 3.65
MACROD1-208ENST00000545464 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.85■■■■□ 3.65
MACROD1-208ENST00000545464 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.85■■■■□ 3.65
MACROD1-208ENST00000545464 JCADQ9P266 1359 aa37.84■■■■□ 3.65
MACROD1-208ENST00000545464 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
MACROD1-208ENST00000545464 UNC13BO14795 1591 aa37.74■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 ATF3P18847 181 aa37.74■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa37.72■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 CADPS2Q86UW7 1296 aa37.72■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.71■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 C19orf44Q9H6X5 657 aa37.71■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 E9PCH4 1651 aa37.71■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 ITGAEP38570 1179 aa37.7■■■■□ 3.63
MACROD1-208ENST00000545464 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 NUP155O75694 1391 aa37.67■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa37.66■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 ROCK1Q13464 1354 aa37.65■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.64■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 PIK3R4Q99570 1358 aa37.64■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 DIP2AQ14689 1571 aa37.63■■■■□ 3.62
MACROD1-208ENST00000545464 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
MACROD1-208ENST00000545464 LRP6O75581 1613 aa37.61■■■■□ 3.61
MACROD1-208ENST00000545464 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.61■■■■□ 3.61
MACROD1-208ENST00000545464 TRPM2O94759 1503 aa37.58■■■■□ 3.61
MACROD1-208ENST00000545464 PTPRUQ92729 1446 aa37.56■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 TRIM52Q96A61 297 aa37.56■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 BRINP3Q76B58 766 aa37.55■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
MACROD1-208ENST00000545464 SHPRHQ149N8 1683 aa37.46■■■■□ 3.59
MACROD1-208ENST00000545464 RXRBP28702 533 aa37.42■■■■□ 3.58
MACROD1-208ENST00000545464 DCCP43146 1447 aa37.4■■■■□ 3.58
MACROD1-208ENST00000545464 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.4■■■■□ 3.58
MACROD1-208ENST00000545464 METP08581 1390 aa37.4■■■■□ 3.58
MACROD1-208ENST00000545464 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.39■■■■□ 3.58
MACROD1-208ENST00000545464 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.38■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.38■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.36■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 MST1RQ04912 1400 aa37.36■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 AFF2P51816 1311 aa37.34■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
MACROD1-208ENST00000545464 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.31■■■■□ 3.56
MACROD1-208ENST00000545464 C8orf37Q96NL8 207 aa37.28■■■■□ 3.56
MACROD1-208ENST00000545464 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.26■■■■□ 3.55
MACROD1-208ENST00000545464 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.23■■■■□ 3.55
MACROD1-208ENST00000545464 CLTCL1P53675 1640 aa37.22■■■■□ 3.55
MACROD1-208ENST00000545464 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.2■■■■□ 3.55
MACROD1-208ENST00000545464 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
MACROD1-208ENST00000545464 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.19■■■■□ 3.54
MACROD1-208ENST00000545464 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
MACROD1-208ENST00000545464 ADAMTS2O95450 1211 aa37.17■■■■□ 3.54
MACROD1-208ENST00000545464 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.16■■■■□ 3.54
MACROD1-208ENST00000545464 NGLY1Q96IV0 654 aa37.14■■■■□ 3.54
MACROD1-208ENST00000545464 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.13■■■■□ 3.54
MACROD1-208ENST00000545464 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
MACROD1-208ENST00000545464 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
MACROD1-208ENST00000545464 KIF1BO60333 1816 aa37.1■■■■□ 3.53
MACROD1-208ENST00000545464 ORAI2Q96SN7 254 aa37.1■■■■□ 3.53
MACROD1-208ENST00000545464 ROBO2Q9HCK4 1378 aa37.07■■■■□ 3.53
MACROD1-208ENST00000545464 RGS12O14924 1447 aa37.07■■■■□ 3.52
MACROD1-208ENST00000545464 NAIPQ13075 1403 aa37.06■■■■□ 3.52
MACROD1-208ENST00000545464 PTCH1Q13635 1447 aa37.03■■■■□ 3.52
MACROD1-208ENST00000545464 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
MACROD1-208ENST00000545464 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
MACROD1-208ENST00000545464 USP21Q9UK80 565 aa36.99■■■■□ 3.51
MACROD1-208ENST00000545464 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.98■■■■□ 3.51
MACROD1-208ENST00000545464 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
MACROD1-208ENST00000545464 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.92■■■■□ 3.5
MACROD1-208ENST00000545464 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
MACROD1-208ENST00000545464 HFM1A2PYH4 1435 aa36.92■■■■□ 3.5
MACROD1-208ENST00000545464 LAMC1P11047 1609 aa36.91■■■■□ 3.5
MACROD1-208ENST00000545464 FOXD1Q16676 465 aa36.87■■■■□ 3.49
MACROD1-208ENST00000545464 STK26Q9P289 416 aa36.86■■■■□ 3.49
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