RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537248.5

ZNF384-208, Transcript of zinc finger protein 384, human

TSL 2

Gene ZNF384, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF384-208	ENST00000537248	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ZNF384-208	ENST00000537248	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.7	■■■□□ 2.18
ZNF384-208	ENST00000537248	LRP6	O75581	1613 aa		28.64	■■■□□ 2.18
ZNF384-208	ENST00000537248	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.63	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.61	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		28.6	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.58	■■■□□ 2.17
ZNF384-208	ENST00000537248	SHPRH	Q149N8	1683 aa		28.58	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.57	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.56	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.54	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	28.54	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.53	■■■□□ 2.16
ZNF384-208	ENST00000537248	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.51	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.49	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.48	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.47	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ZNF384-208	ENST00000537248	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.44	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.43	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.42	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.4	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	ATF3	P18847	181 aa		28.39	■■■□□ 2.14
ZNF384-208	ENST00000537248	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	RXRB	P28702	533 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	28.38	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248		E9PCH4	1651 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	UNC13B	O14795	1591 aa		28.37	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	APLP2	Q06481	763 aa		28.35	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	TRPM2	O94759	1503 aa		28.34	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		28.33	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.33	■■■□□ 2.13
ZNF384-208	ENST00000537248	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.32	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	DCC	P43146	1447 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	AFF2	P51816	1311 aa		28.28	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.27	■■■□□ 2.12
ZNF384-208	ENST00000537248	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ZNF384-208	ENST00000537248	MST1R	Q04912	1400 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ZNF384-208	ENST00000537248	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
ZNF384-208	ENST00000537248	RGS12	O14924	1447 aa		28.24	■■■□□ 2.11
ZNF384-208	ENST00000537248	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.2	■■■□□ 2.11
ZNF384-208	ENST00000537248	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
ZNF384-208	ENST00000537248	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ZNF384-208	ENST00000537248	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ZNF384-208	ENST00000537248	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ZNF384-208	ENST00000537248	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ZNF384-208	ENST00000537248	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ZNF384-208	ENST00000537248	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	EP400	Q96L91	3159 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	MET	P08581	1390 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	LAMC1	P11047	1609 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ZNF384-208	ENST00000537248	NUP155	O75694	1391 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ZNF384-208	ENST00000537248	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ZNF384-208	ENST00000537248	ADAMTS2	O95450	1211 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ZNF384-208	ENST00000537248	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	CLTCL1	P53675	1640 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.07
ZNF384-208	ENST00000537248	USP21	Q9UK80	565 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	PTCH1	Q13635	1447 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	KIF1B	O60333	1816 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	ATRN	O75882	1429 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	ORAI2	Q96SN7	254 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
ZNF384-208	ENST00000537248	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ZNF384-208	ENST00000537248	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ZNF384-208	ENST00000537248	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ZNF384-208	ENST00000537248	MYOM2	P54296	1465 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ZNF384-208	ENST00000537248	FOXD1	Q16676	465 aa		27.82	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms