RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-214	ENST00000534206	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		43.62	■■■■■ 4.57
ACER3-214	ENST00000534206	ITGAE	P38570	1179 aa		43.6	■■■■■ 4.57
ACER3-214	ENST00000534206	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	43.57	■■■■■ 4.57
ACER3-214	ENST00000534206	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.55	■■■■■ 4.56
ACER3-214	ENST00000534206	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.54	■■■■■ 4.56
ACER3-214	ENST00000534206	NUP155	O75694	1391 aa		43.53	■■■■■ 4.56
ACER3-214	ENST00000534206	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.51	■■■■■ 4.56
ACER3-214	ENST00000534206	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.51	■■■■■ 4.56
ACER3-214	ENST00000534206	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.49	■■■■■ 4.55
ACER3-214	ENST00000534206	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
ACER3-214	ENST00000534206	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.45	■■■■■ 4.55
ACER3-214	ENST00000534206	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
ACER3-214	ENST00000534206	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.42	■■■■■ 4.54
ACER3-214	ENST00000534206	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.4	■■■■■ 4.54
ACER3-214	ENST00000534206	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.4	■■■■■ 4.54
ACER3-214	ENST00000534206	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.39	■■■■■ 4.54
ACER3-214	ENST00000534206	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.39	■■■■■ 4.54
ACER3-214	ENST00000534206	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.37	■■■■■ 4.53
ACER3-214	ENST00000534206	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
ACER3-214	ENST00000534206	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.37	■■■■■ 4.53
ACER3-214	ENST00000534206	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.37	■■■■■ 4.53
ACER3-214	ENST00000534206	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.36	■■■■■ 4.53
ACER3-214	ENST00000534206	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.34	■■■■■ 4.53
ACER3-214	ENST00000534206	NAIP	Q13075	1403 aa		43.27	■■■■■ 4.52
ACER3-214	ENST00000534206	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		43.23	■■■■■ 4.51
ACER3-214	ENST00000534206	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.22	■■■■■ 4.51
ACER3-214	ENST00000534206	MSH6	P52701	1360 aa		43.19	■■■■■ 4.5
ACER3-214	ENST00000534206	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.19	■■■■■ 4.5
ACER3-214	ENST00000534206	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.16	■■■■■ 4.5
ACER3-214	ENST00000534206	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.16	■■■■■ 4.5
ACER3-214	ENST00000534206	SLAIN2	Q9P270	581 aa		43.15	■■■■■ 4.5
ACER3-214	ENST00000534206	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.14	■■■■■ 4.5
ACER3-214	ENST00000534206	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.13	■■■■■ 4.49
ACER3-214	ENST00000534206	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
ACER3-214	ENST00000534206	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	43.1	■■■■■ 4.49
ACER3-214	ENST00000534206	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ACER3-214	ENST00000534206	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ACER3-214	ENST00000534206	TRPM2	O94759	1503 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ACER3-214	ENST00000534206	HFM1	A2PYH4	1435 aa		43.05	■■■■■ 4.48
ACER3-214	ENST00000534206	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.05	■■■■■ 4.48
ACER3-214	ENST00000534206	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
ACER3-214	ENST00000534206	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.99	■■■■■ 4.47
ACER3-214	ENST00000534206	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
ACER3-214	ENST00000534206	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.98	■■■■■ 4.47
ACER3-214	ENST00000534206	MET	P08581	1390 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ACER3-214	ENST00000534206	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
ACER3-214	ENST00000534206	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.93	■■■■■ 4.46
ACER3-214	ENST00000534206	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.91	■■■■■ 4.46
ACER3-214	ENST00000534206	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ACER3-214	ENST00000534206	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ACER3-214	ENST00000534206	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
ACER3-214	ENST00000534206	KIF1B	O60333	1816 aa		42.87	■■■■■ 4.45
ACER3-214	ENST00000534206	ATF3	P18847	181 aa		42.84	■■■■■ 4.45
ACER3-214	ENST00000534206	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
ACER3-214	ENST00000534206	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.82	■■■■■ 4.45
ACER3-214	ENST00000534206	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ACER3-214	ENST00000534206	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
ACER3-214	ENST00000534206	DCC	P43146	1447 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ACER3-214	ENST00000534206	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.77	■■■■■ 4.44
ACER3-214	ENST00000534206	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
ACER3-214	ENST00000534206	FOXD1	Q16676	465 aa		42.74	■■■■■ 4.43
ACER3-214	ENST00000534206	MST1R	Q04912	1400 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ACER3-214	ENST00000534206	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.69	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	LRP6	O75581	1613 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.67	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	PPL	O60437	1756 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.63	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.63	■■■■■ 4.42
ACER3-214	ENST00000534206	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ACER3-214	ENST00000534206	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ACER3-214	ENST00000534206	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ACER3-214	ENST00000534206	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ACER3-214	ENST00000534206	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ACER3-214	ENST00000534206	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.58	■■■■■ 4.41
ACER3-214	ENST00000534206	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.55	■■■■■ 4.4
ACER3-214	ENST00000534206	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ACER3-214	ENST00000534206	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ACER3-214	ENST00000534206	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
ACER3-214	ENST00000534206	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.5	■■■■■ 4.39
ACER3-214	ENST00000534206	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ACER3-214	ENST00000534206	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ACER3-214	ENST00000534206	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.44	■■■■■ 4.38
ACER3-214	ENST00000534206	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.41	■■■■■ 4.38
ACER3-214	ENST00000534206	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	LAMC1	P11047	1609 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.34	■■■■■ 4.37
ACER3-214	ENST00000534206	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
ACER3-214	ENST00000534206	TECPR2	O15040	1411 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ACER3-214	ENST00000534206	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.29	■■■■■ 4.36
ACER3-214	ENST00000534206	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
ACER3-214	ENST00000534206	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
ACER3-214	ENST00000534206	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ACER3-214	ENST00000534206	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.25	■■■■■ 4.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms