RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCAMP50895 628 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDE4DQ08499 809 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 STAC3Q96MF2 364 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF40O75150 1001 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAJB2P25686 324 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 AMHR2Q16671 573 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 LAPTM4BQ86VI4 370 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 WNT2BQ93097 391 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC10A3P09131 477 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 MS4A1P11836 297 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 NEUROD2Q15784 382 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOWAHBA6NEL2 793 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPN5P54829 565 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKK1Q8NFD2 765 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRCH3Q96II8 777 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLCN1P35523 988 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 WBP1LQ9NX94 342 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 RDH13Q8NBN7 331 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM117AQ9C073 453 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD46P15529 392 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 APLP1P51693 650 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 LAPTM4AQ15012 233 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFFO2Q5TF58 517 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-344P-201ENST00000516635 CFHP08603 1231 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP4CP60510 307 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLF2Q8IX21 1173 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL27Q8NEV9 243 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 HLA-CQ95604 372 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 GCGRP47871 477 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 SULF1Q8IWU6 871 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 GUCA2AQ02747 115 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 FUT2Q10981 343 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFV2P19404 249 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC4A3P48751 1232 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 KDM4AO75164 1064 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 COPS2P61201 443 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-344P-201ENST00000516635 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXA2O43364 376 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF516Q92618 1163 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTRQ99707 1265 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 TLL1O43897 1013 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 MORN1Q5T089 497 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A0G2JS52 829 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP6V1AP38606 617 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 QPCTQ16769 361 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 CABLES1Q8TDN4 633 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 NECTIN2Q92692 538 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR14Q9BWN1 585 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZPR1O75312 459 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms