RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515760.1

PEX10-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 10, human

TSL 4

Gene PEX10, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX10-208	ENST00000515760	KCNA6	P17658	529 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PEX10-208	ENST00000515760	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760		E9PCH4	1651 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PEX10-208	ENST00000515760	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PEX10-208	ENST00000515760	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PEX10-208	ENST00000515760	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PEX10-208	ENST00000515760	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PEX10-208	ENST00000515760	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PEX10-208	ENST00000515760	MSH6	P52701	1360 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PEX10-208	ENST00000515760	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PEX10-208	ENST00000515760	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PEX10-208	ENST00000515760	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PEX10-208	ENST00000515760	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PEX10-208	ENST00000515760	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PEX10-208	ENST00000515760	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.16	■■■□□ 2.74
PEX10-208	ENST00000515760	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PEX10-208	ENST00000515760	NUP155	O75694	1391 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	ITGAE	P38570	1179 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	TRPM2	O94759	1503 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PEX10-208	ENST00000515760	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PEX10-208	ENST00000515760	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PEX10-208	ENST00000515760	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PEX10-208	ENST00000515760	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PEX10-208	ENST00000515760	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PEX10-208	ENST00000515760	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PEX10-208	ENST00000515760	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PEX10-208	ENST00000515760	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PEX10-208	ENST00000515760	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PEX10-208	ENST00000515760	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PEX10-208	ENST00000515760	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PEX10-208	ENST00000515760	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PEX10-208	ENST00000515760	ATF3	P18847	181 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	LRP6	O75581	1613 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	DCC	P43146	1447 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	KIF1B	O60333	1816 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PEX10-208	ENST00000515760	MET	P08581	1390 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	NAIP	Q13075	1403 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	MST1R	Q04912	1400 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PEX10-208	ENST00000515760	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PEX10-208	ENST00000515760	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PEX10-208	ENST00000515760	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PEX10-208	ENST00000515760	PPL	O60437	1756 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PEX10-208	ENST00000515760	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PEX10-208	ENST00000515760	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PEX10-208	ENST00000515760	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	LAMC1	P11047	1609 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	AFF2	P51816	1311 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	RXRB	P28702	533 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
PEX10-208	ENST00000515760	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.47	■■■□□ 2.63
PEX10-208	ENST00000515760	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PEX10-208	ENST00000515760	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	FOXD1	Q16676	465 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	RGS12	O14924	1447 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PEX10-208	ENST00000515760	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PEX10-208	ENST00000515760	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PEX10-208	ENST00000515760	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.35	■■■□□ 2.61

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