RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
SIMC1-211ENST00000514128 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.1■■■■□ 3.53
SIMC1-211ENST00000514128 ZFYVE9O95405 1425 aa37.1■■■■□ 3.53
SIMC1-211ENST00000514128 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.1■■■■□ 3.53
SIMC1-211ENST00000514128 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
SIMC1-211ENST00000514128 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.04■■■■□ 3.52
SIMC1-211ENST00000514128 NWD1Q149M9 1564 aa37.04■■■■□ 3.52
SIMC1-211ENST00000514128 KCNA6P17658 529 aa37.04■■■■□ 3.52
SIMC1-211ENST00000514128 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
SIMC1-211ENST00000514128 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.02■■■■□ 3.52
SIMC1-211ENST00000514128 ILDR2Q71H61 639 aa37■■■■□ 3.51
SIMC1-211ENST00000514128 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM94Q12767 1356 aa37■■■■□ 3.51
SIMC1-211ENST00000514128 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
SIMC1-211ENST00000514128 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
SIMC1-211ENST00000514128 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
SIMC1-211ENST00000514128 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
SIMC1-211ENST00000514128 NAIPQ13075 1403 aa36.92■■■■□ 3.5
SIMC1-211ENST00000514128 DIP2AQ14689 1571 aa36.91■■■■□ 3.5
SIMC1-211ENST00000514128 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
SIMC1-211ENST00000514128 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
SIMC1-211ENST00000514128 MSH6P52701 1360 aa36.85■■■■□ 3.49
SIMC1-211ENST00000514128 TBX22Q9Y458 520 aa36.84■■■■□ 3.49
SIMC1-211ENST00000514128 HFM1A2PYH4 1435 aa36.83■■■■□ 3.49
SIMC1-211ENST00000514128 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.82■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 TRPM2O94759 1503 aa36.8■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.8■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 SOCS7O14512 581 aa36.8■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.8■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 CLTCL1P53675 1640 aa36.78■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 KIF1BO60333 1816 aa36.77■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 PIK3R4Q99570 1358 aa36.77■■■■□ 3.48
SIMC1-211ENST00000514128 TRIM52Q96A61 297 aa36.75■■■■□ 3.47
SIMC1-211ENST00000514128 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
SIMC1-211ENST00000514128 C14orf37Q86TY3 774 aa36.71■■■■□ 3.47
SIMC1-211ENST00000514128 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.7■■■■□ 3.47
SIMC1-211ENST00000514128 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.69■■■■□ 3.46
SIMC1-211ENST00000514128 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.69■■■■□ 3.46
SIMC1-211ENST00000514128 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.64■■■■□ 3.46
SIMC1-211ENST00000514128 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 SLAIN2Q9P270 581 aa36.63■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 PHLPP1O60346 1717 aa36.6■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.6■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 PTPRUQ92729 1446 aa36.59■■■■□ 3.45
SIMC1-211ENST00000514128 ATF3P18847 181 aa36.55■■■■□ 3.44
SIMC1-211ENST00000514128 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.54■■■■□ 3.44
SIMC1-211ENST00000514128 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.54■■■■□ 3.44
SIMC1-211ENST00000514128 METP08581 1390 aa36.49■■■■□ 3.43
SIMC1-211ENST00000514128 DCCP43146 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
SIMC1-211ENST00000514128 PPLO60437 1756 aa36.45■■■■□ 3.43
SIMC1-211ENST00000514128 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
SIMC1-211ENST00000514128 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.42■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 JCADQ9P266 1359 aa36.41■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.4■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 FOXD1Q16676 465 aa36.39■■■■□ 3.42
SIMC1-211ENST00000514128 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.37■■■■□ 3.41
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.36■■■■□ 3.41
SIMC1-211ENST00000514128 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.33■■■■□ 3.41
SIMC1-211ENST00000514128 PTCH1Q13635 1447 aa36.32■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.3■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 MST1RQ04912 1400 aa36.3■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 BRINP3Q76B58 766 aa36.29■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 SHPRHQ149N8 1683 aa36.28■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.26■■■■□ 3.4
SIMC1-211ENST00000514128 IFT172Q9UG01 1749 aa36.25■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.23■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.23■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.23■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.23■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 RGL3Q3MIN7 710 aa36.21■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.21■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.2■■■■□ 3.39
SIMC1-211ENST00000514128 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
SIMC1-211ENST00000514128 LRP6O75581 1613 aa36.16■■■■□ 3.38
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.14■■■■□ 3.38
SIMC1-211ENST00000514128 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.13■■■■□ 3.37
SIMC1-211ENST00000514128 POTEAQ6S8J7 498 aa36.12■■■■□ 3.37
SIMC1-211ENST00000514128 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.11■■■■□ 3.37
SIMC1-211ENST00000514128 PIK3C2GO75747 1445 aa36.08■■■■□ 3.37
SIMC1-211ENST00000514128 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.06■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.06■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 TECPR2O15040 1411 aa36.02■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 LAMC1P11047 1609 aa36.02■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 STK26Q9P289 416 aa36.02■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
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