RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFYVE9O95405 1425 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAIPQ13075 1403 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNA6P17658 529 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA1LP34931 641 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALKQ9UM73 1620 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM52Q96A61 297 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HFM1A2PYH4 1435 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM94Q12767 1356 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBX22Q9Y458 520 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NWD1Q149M9 1564 aa35.06■■■■□ 3.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35■■■■□ 3.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPM2O94759 1503 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLTCL1P53675 1640 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ILDR2Q71H61 639 aa34.97■■■■□ 3.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIP2AQ14689 1571 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSH6P52701 1360 aa34.95■■■■□ 3.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF1BO60333 1816 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3R4Q99570 1358 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C14orf37Q86TY3 774 aa34.89■■■■□ 3.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLAIN2Q9P270 581 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.82■■■■□ 3.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXD1Q16676 465 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRUQ92729 1446 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METP08581 1390 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATF3P18847 181 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.73■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOCS7O14512 581 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.68■■■■□ 3.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPLO60437 1756 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHLPP1O60346 1717 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGL3Q3MIN7 710 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCCP43146 1447 aa34.55■■■■□ 3.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.51■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JCADQ9P266 1359 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRINP3Q76B58 766 aa34.49■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.48■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MST1RQ04912 1400 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTCH1Q13635 1447 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.45■■■■□ 3.11
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFT172Q9UG01 1749 aa34.43■■■■□ 3.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STK26Q9P289 416 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIK3C2GO75747 1445 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HRCP23327 699 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHPRHQ149N8 1683 aa34.29■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.29■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTEAQ6S8J7 498 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ORAI2Q96SN7 254 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC11Q96J66 1382 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TECPR2O15040 1411 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
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