RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.95	■■■■■ 4.15
MIB2-215	ENST00000502470	TOM1	O60784	492 aa		40.92	■■■■■ 4.14
MIB2-215	ENST00000502470	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
MIB2-215	ENST00000502470	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		40.88	■■■■■ 4.14
MIB2-215	ENST00000502470	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.88	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	BCAN	Q96GW7	911 aa		40.87	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.86	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.83	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.83	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	NWD1	Q149M9	1564 aa		40.82	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	KCNA6	P17658	529 aa		40.82	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
MIB2-215	ENST00000502470	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.81	■■■■■ 4.12
MIB2-215	ENST00000502470	TRPM2	O94759	1503 aa		40.8	■■■■■ 4.12
MIB2-215	ENST00000502470	KIF1B	O60333	1816 aa		40.76	■■■■■ 4.12
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM94	Q12767	1356 aa		40.73	■■■■■ 4.11
MIB2-215	ENST00000502470	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
MIB2-215	ENST00000502470	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.72	■■■■■ 4.11
MIB2-215	ENST00000502470	HSPA1L	P34931	641 aa		40.71	■■■■■ 4.11
MIB2-215	ENST00000502470	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.69	■■■■■ 4.11
MIB2-215	ENST00000502470	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
MIB2-215	ENST00000502470	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.1
MIB2-215	ENST00000502470	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.69	■■■■■ 4.1
MIB2-215	ENST00000502470	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
MIB2-215	ENST00000502470	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
MIB2-215	ENST00000502470	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.64	■■■■■ 4.1
MIB2-215	ENST00000502470	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.62	■■■■■ 4.09
MIB2-215	ENST00000502470	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.62	■■■■■ 4.09
MIB2-215	ENST00000502470	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.58	■■■■■ 4.09
MIB2-215	ENST00000502470	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.55	■■■■■ 4.08
MIB2-215	ENST00000502470	FOXD1	Q16676	465 aa		40.54	■■■■■ 4.08
MIB2-215	ENST00000502470	PTPRU	Q92729	1446 aa		40.5	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	MSH6	P52701	1360 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		40.47	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	PPL	O60437	1756 aa		40.45	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	40.45	■■■■■ 4.07
MIB2-215	ENST00000502470	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		40.43	■■■■■ 4.06
MIB2-215	ENST00000502470	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		40.42	■■■■■ 4.06
MIB2-215	ENST00000502470	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		40.41	■■■■■ 4.06
MIB2-215	ENST00000502470	MET	P08581	1390 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MIB2-215	ENST00000502470	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
MIB2-215	ENST00000502470	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
MIB2-215	ENST00000502470	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.35	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.34	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	C14orf37	Q86TY3	774 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		40.33	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
MIB2-215	ENST00000502470	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.04
MIB2-215	ENST00000502470	SLAIN2	Q9P270	581 aa		40.3	■■■■■ 4.04
MIB2-215	ENST00000502470	IFT172	Q9UG01	1749 aa		40.29	■■■■■ 4.04
MIB2-215	ENST00000502470	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		40.26	■■■■■ 4.04
MIB2-215	ENST00000502470	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		40.25	■■■■■ 4.03
MIB2-215	ENST00000502470	RGL3	Q3MIN7	710 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MIB2-215	ENST00000502470	PHLPP1	O60346	1717 aa		40.21	■■■■■ 4.03
MIB2-215	ENST00000502470	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.19	■■■■■ 4.02
MIB2-215	ENST00000502470	ATF3	P18847	181 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MIB2-215	ENST00000502470	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		40.17	■■■■■ 4.02
MIB2-215	ENST00000502470	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		40.15	■■■■■ 4.02
MIB2-215	ENST00000502470	DCC	P43146	1447 aa		40.13	■■■■■ 4.01
MIB2-215	ENST00000502470	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		40.1	■■■■■ 4.01
MIB2-215	ENST00000502470	PTCH1	Q13635	1447 aa		40.08	■■■■■ 4.01
MIB2-215	ENST00000502470	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		40.08	■■■■■ 4.01
MIB2-215	ENST00000502470	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
MIB2-215	ENST00000502470	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		40.06	■■■■■ 4
MIB2-215	ENST00000502470	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		40.06	■■■■■ 4
MIB2-215	ENST00000502470	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
MIB2-215	ENST00000502470	MST1R	Q04912	1400 aa		40.03	■■■■■ 4
MIB2-215	ENST00000502470	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	40.02	■■■■■ 4
MIB2-215	ENST00000502470	HRC	P23327	699 aa		40.01	■■■■■ 4
MIB2-215	ENST00000502470	PIK3C2G	O75747	1445 aa		39.99	■■■■□ 3.99
MIB2-215	ENST00000502470	BRINP3	Q76B58	766 aa		39.99	■■■■□ 3.99
MIB2-215	ENST00000502470	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		39.98	■■■■□ 3.99
MIB2-215	ENST00000502470	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		39.93	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	JCAD	Q9P266	1359 aa		39.93	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		39.93	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	SOCS7	O14512	581 aa		39.91	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	MYOM2	P54296	1465 aa		39.91	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		39.91	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		39.89	■■■■□ 3.98
MIB2-215	ENST00000502470	SHPRH	Q149N8	1683 aa		39.87	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	STK26	Q9P289	416 aa		39.87	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	39.86	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	TECPR2	O15040	1411 aa		39.86	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	LAMC1	P11047	1609 aa		39.86	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		39.84	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	39.83	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	39.82	■■■■□ 3.97
MIB2-215	ENST00000502470	ABCC11	Q96J66	1382 aa		39.81	■■■■□ 3.96
MIB2-215	ENST00000502470	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	39.81	■■■■□ 3.96
MIB2-215	ENST00000502470	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		39.79	■■■■□ 3.96
MIB2-215	ENST00000502470	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		39.79	■■■■□ 3.96
MIB2-215	ENST00000502470	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		39.79	■■■■□ 3.96
MIB2-215	ENST00000502470	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	39.77	■■■■□ 3.96

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