RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-204ENST00000490751 BCANQ96GW7 911 aa47.31■■■■■ 5.16
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LDB1-204ENST00000490751 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa47.29■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 ALKQ9UM73 1620 aa47.28■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 PIP4K2BP78356 416 aa47.28■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
LDB1-204ENST00000490751 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP47.24■■■■■ 5.15
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LDB1-204ENST00000490751 KCNA6P17658 529 aa47.22■■■■■ 5.15
LDB1-204ENST00000490751 NWD1Q149M9 1564 aa47.2■■■■■ 5.15
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LDB1-204ENST00000490751 TRPM2O94759 1503 aa47.18■■■■■ 5.14
LDB1-204ENST00000490751 CLTCL1P53675 1640 aa47.16■■■■■ 5.14
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LDB1-204ENST00000490751 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa47.07■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 HSPA1LP34931 641 aa47.07■■■■■ 5.13
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LDB1-204ENST00000490751 TBX22Q9Y458 520 aa47.07■■■■■ 5.13
LDB1-204ENST00000490751 DIP2AQ14689 1571 aa47.07■■■■■ 5.12
LDB1-204ENST00000490751 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
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LDB1-204ENST00000490751 DISP3Q9P2K9 1392 aa47■■■■■ 5.12
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LDB1-204ENST00000490751 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa46.91■■■■■ 5.1
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LDB1-204ENST00000490751 MSH6P52701 1360 aa46.84■■■■■ 5.09
LDB1-204ENST00000490751 SETD5Q9C0A6 1442 aa46.8■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 PTPRUQ92729 1446 aa46.79■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 MPHOSPH9Q99550 1183 aa46.79■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 FAM135BQ49AJ0 1406 aa46.76■■■■■ 5.08
LDB1-204ENST00000490751 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa46.75■■■■■ 5.07
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LDB1-204ENST00000490751 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
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LDB1-204ENST00000490751 C14orf37Q86TY3 774 aa46.69■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 METP08581 1390 aa46.69■■■■■ 5.06
LDB1-204ENST00000490751 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.69■■■■■ 5.06
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LDB1-204ENST00000490751 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa46.64■■■■■ 5.06
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LDB1-204ENST00000490751 SLAIN2Q9P270 581 aa46.61■■■■■ 5.05
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LDB1-204ENST00000490751 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.54■■■■■ 5.04
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LDB1-204ENST00000490751 PHLPP1O60346 1717 aa46.45■■■■■ 5.03
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LDB1-204ENST00000490751 NALCNQ8IZF0 1738 aa46.39■■■■■ 5.02
LDB1-204ENST00000490751 PTCH1Q13635 1447 aa46.37■■■■■ 5.01
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LDB1-204ENST00000490751 CFAP70Q5T0N1 1121 aa45.99■■■■■ 4.95
LDB1-204ENST00000490751 WAPLQ7Z5K2 1190 aa45.99■■■■■ 4.95
LDB1-204ENST00000490751 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa45.97■■■■■ 4.95
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