RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 RIMS2Q9UQ26 1411 aa44.18■■■■■ 4.66
MTMR1-211ENST00000490316 CHGAP10645 457 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
MTMR1-211ENST00000490316 BCANQ96GW7 911 aa44.16■■■■■ 4.66
MTMR1-211ENST00000490316 NAIPQ13075 1403 aa44.16■■■■■ 4.66
MTMR1-211ENST00000490316 KCNA6P17658 529 aa44.14■■■■■ 4.66
MTMR1-211ENST00000490316 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
MTMR1-211ENST00000490316 HSPA1LP34931 641 aa44.12■■■■■ 4.65
MTMR1-211ENST00000490316 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa44.12■■■■■ 4.65
MTMR1-211ENST00000490316 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
MTMR1-211ENST00000490316 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP44.09■■■■■ 4.65
MTMR1-211ENST00000490316 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
MTMR1-211ENST00000490316 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.05■■■■■ 4.64
MTMR1-211ENST00000490316 HFM1A2PYH4 1435 aa44.02■■■■■ 4.64
MTMR1-211ENST00000490316 NWD1Q149M9 1564 aa44.01■■■■■ 4.64
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM94Q12767 1356 aa44.01■■■■■ 4.64
MTMR1-211ENST00000490316 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
MTMR1-211ENST00000490316 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
MTMR1-211ENST00000490316 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
MTMR1-211ENST00000490316 TBX22Q9Y458 520 aa43.96■■■■■ 4.63
MTMR1-211ENST00000490316 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
MTMR1-211ENST00000490316 TRIM52Q96A61 297 aa43.91■■■■■ 4.62
MTMR1-211ENST00000490316 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
MTMR1-211ENST00000490316 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa43.89■■■■■ 4.62
MTMR1-211ENST00000490316 TRPM2O94759 1503 aa43.86■■■■■ 4.61
MTMR1-211ENST00000490316 DIP2AQ14689 1571 aa43.86■■■■■ 4.61
MTMR1-211ENST00000490316 ILDR2Q71H61 639 aa43.86■■■■■ 4.61
MTMR1-211ENST00000490316 CLTCL1P53675 1640 aa43.84■■■■■ 4.61
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
MTMR1-211ENST00000490316 PIK3R4Q99570 1358 aa43.8■■■■■ 4.6
MTMR1-211ENST00000490316 FAM135BQ49AJ0 1406 aa43.77■■■■■ 4.6
MTMR1-211ENST00000490316 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
MTMR1-211ENST00000490316 MSH6P52701 1360 aa43.77■■■■■ 4.6
MTMR1-211ENST00000490316 KIF1BO60333 1816 aa43.73■■■■■ 4.59
MTMR1-211ENST00000490316 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
MTMR1-211ENST00000490316 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa43.7■■■■■ 4.59
MTMR1-211ENST00000490316 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa43.7■■■■■ 4.59
MTMR1-211ENST00000490316 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa43.69■■■■■ 4.58
MTMR1-211ENST00000490316 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa43.67■■■■■ 4.58
MTMR1-211ENST00000490316 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa43.65■■■■■ 4.58
MTMR1-211ENST00000490316 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa43.65■■■■■ 4.58
MTMR1-211ENST00000490316 PTPRUQ92729 1446 aa43.64■■■■■ 4.58
MTMR1-211ENST00000490316 SLAIN2Q9P270 581 aa43.62■■■■■ 4.57
MTMR1-211ENST00000490316 C14orf37Q86TY3 774 aa43.6■■■■■ 4.57
MTMR1-211ENST00000490316 FOXD1Q16676 465 aa43.54■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 C19orf44Q9H6X5 657 aa43.54■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 METP08581 1390 aa43.53■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 SOCS7O14512 581 aa43.52■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 VGFO15240 615 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
MTMR1-211ENST00000490316 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.5■■■■■ 4.55
MTMR1-211ENST00000490316 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.49■■■■■ 4.55
MTMR1-211ENST00000490316 CADPS2Q86UW7 1296 aa43.48■■■■■ 4.55
MTMR1-211ENST00000490316 ATF3P18847 181 aa43.46■■■■■ 4.55
MTMR1-211ENST00000490316 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
MTMR1-211ENST00000490316 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
MTMR1-211ENST00000490316 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.42■■■■■ 4.54
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.41■■■■■ 4.54
MTMR1-211ENST00000490316 PPLO60437 1756 aa43.4■■■■■ 4.54
MTMR1-211ENST00000490316 PHLPP1O60346 1717 aa43.39■■■■■ 4.54
MTMR1-211ENST00000490316 DCCP43146 1447 aa43.36■■■■■ 4.53
MTMR1-211ENST00000490316 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
MTMR1-211ENST00000490316 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.28■■■■■ 4.52
MTMR1-211ENST00000490316 RGL3Q3MIN7 710 aa43.27■■■■■ 4.52
MTMR1-211ENST00000490316 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
MTMR1-211ENST00000490316 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.25■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa43.24■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 JCADQ9P266 1359 aa43.24■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 PTCH1Q13635 1447 aa43.22■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 BRINP3Q76B58 766 aa43.22■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 NALCNQ8IZF0 1738 aa43.2■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 MST1RQ04912 1400 aa43.2■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa43.2■■■■■ 4.51
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.19■■■■■ 4.5
MTMR1-211ENST00000490316 IFT172Q9UG01 1749 aa43.19■■■■■ 4.5
MTMR1-211ENST00000490316 ROBO2Q9HCK4 1378 aa43.17■■■■■ 4.5
MTMR1-211ENST00000490316 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.17■■■■■ 4.5
MTMR1-211ENST00000490316 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
MTMR1-211ENST00000490316 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa43.12■■■■■ 4.49
MTMR1-211ENST00000490316 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa43.04■■■■■ 4.48
MTMR1-211ENST00000490316 NHSL1Q5SYE7 1610 aa43.03■■■■■ 4.48
MTMR1-211ENST00000490316 PIK3C2GO75747 1445 aa43.03■■■■■ 4.48
MTMR1-211ENST00000490316 SHPRHQ149N8 1683 aa43.02■■■■■ 4.48
MTMR1-211ENST00000490316 C1orf167Q5SNV9 1468 aa43■■■■■ 4.47
MTMR1-211ENST00000490316 HRCP23327 699 aa42.98■■■■■ 4.47
MTMR1-211ENST00000490316 STK26Q9P289 416 aa42.96■■■■■ 4.47
MTMR1-211ENST00000490316 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM132EQ6IEE7 984 aa42.95■■■■■ 4.47
MTMR1-211ENST00000490316 TECPR2O15040 1411 aa42.95■■■■■ 4.47
MTMR1-211ENST00000490316 LRP6O75581 1613 aa42.94■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 POTEAQ6S8J7 498 aa42.93■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC11Q96J66 1382 aa42.91■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 MYOM2P54296 1465 aa42.91■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 NRXN1Q9ULB1 1477 aa42.9■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.88■■■■■ 4.46
MTMR1-211ENST00000490316 ORAI2Q96SN7 254 aa42.88■■■■■ 4.45
MTMR1-211ENST00000490316 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms