RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487034.5

RPL13-208, Transcript of ribosomal protein L13, human

TSL 1 (best)

Gene RPL13, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL13-208	ENST00000487034	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		34.01	■■■■□ 3.04
RPL13-208	ENST00000487034	PIP4K2B	P78356	416 aa		34.01	■■■■□ 3.03
RPL13-208	ENST00000487034	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		34	■■■■□ 3.03
RPL13-208	ENST00000487034	HSPA1L	P34931	641 aa		33.98	■■■■□ 3.03
RPL13-208	ENST00000487034	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.97	■■■■□ 3.03
RPL13-208	ENST00000487034	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
RPL13-208	ENST00000487034	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
RPL13-208	ENST00000487034	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RPL13-208	ENST00000487034	KCNA6	P17658	529 aa		33.92	■■■■□ 3.02
RPL13-208	ENST00000487034	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.92	■■■■□ 3.02
RPL13-208	ENST00000487034	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.91	■■■■□ 3.02
RPL13-208	ENST00000487034	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RPL13-208	ENST00000487034	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.89	■■■■□ 3.02
RPL13-208	ENST00000487034	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RPL13-208	ENST00000487034	TRPM2	O94759	1503 aa		33.88	■■■■□ 3.01
RPL13-208	ENST00000487034	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RPL13-208	ENST00000487034	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
RPL13-208	ENST00000487034	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RPL13-208	ENST00000487034	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
RPL13-208	ENST00000487034	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.79	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.77	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.77	■■■■□ 3
RPL13-208	ENST00000487034	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.75	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RPL13-208	ENST00000487034	KIF1B	O60333	1816 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RPL13-208	ENST00000487034	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RPL13-208	ENST00000487034	MSH6	P52701	1360 aa		33.64	■■■□□ 2.98
RPL13-208	ENST00000487034	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
RPL13-208	ENST00000487034	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
RPL13-208	ENST00000487034	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RPL13-208	ENST00000487034	MET	P08581	1390 aa		33.57	■■■□□ 2.96
RPL13-208	ENST00000487034	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
RPL13-208	ENST00000487034	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
RPL13-208	ENST00000487034	PPL	O60437	1756 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPL13-208	ENST00000487034	SOCS7	O14512	581 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPL13-208	ENST00000487034	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RPL13-208	ENST00000487034	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RPL13-208	ENST00000487034	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
RPL13-208	ENST00000487034	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RPL13-208	ENST00000487034	FOXD1	Q16676	465 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RPL13-208	ENST00000487034	DCC	P43146	1447 aa		33.45	■■■□□ 2.95
RPL13-208	ENST00000487034	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RPL13-208	ENST00000487034	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
RPL13-208	ENST00000487034	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPL13-208	ENST00000487034	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPL13-208	ENST00000487034	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RPL13-208	ENST00000487034	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RPL13-208	ENST00000487034	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	MST1R	Q04912	1400 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RPL13-208	ENST00000487034	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	ATF3	P18847	181 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.26	■■■□□ 2.92
RPL13-208	ENST00000487034	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RPL13-208	ENST00000487034	LRP6	O75581	1613 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RPL13-208	ENST00000487034	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RPL13-208	ENST00000487034	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	LAMC1	P11047	1609 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	TECPR2	O15040	1411 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RPL13-208	ENST00000487034	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RPL13-208	ENST00000487034	MYOM2	P54296	1465 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RPL13-208	ENST00000487034	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RPL13-208	ENST00000487034	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RPL13-208	ENST00000487034	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RPL13-208	ENST00000487034	HRC	P23327	699 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RPL13-208	ENST00000487034	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
RPL13-208	ENST00000487034	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
RPL13-208	ENST00000487034	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RPL13-208	ENST00000487034	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33	■■■□□ 2.87
RPL13-208	ENST00000487034	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87

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