RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 BCANQ96GW7 911 aa28.31■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.29■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 ZFYVE9O95405 1425 aa28.28■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.27■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 KCNA6P17658 529 aa28.27■■■□□ 2.12
CLK1-211ENST00000481641 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CLK1-211ENST00000481641 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CLK1-211ENST00000481641 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CLK1-211ENST00000481641 TMEM94Q12767 1356 aa28.23■■■□□ 2.11
CLK1-211ENST00000481641 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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CLK1-211ENST00000481641 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CLK1-211ENST00000481641 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
CLK1-211ENST00000481641 NWD1Q149M9 1564 aa28.16■■■□□ 2.1
CLK1-211ENST00000481641 NAIPQ13075 1403 aa28.15■■■□□ 2.1
CLK1-211ENST00000481641 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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CLK1-211ENST00000481641 TBX22Q9Y458 520 aa28.11■■■□□ 2.09
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CLK1-211ENST00000481641 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.09■■■□□ 2.09
CLK1-211ENST00000481641 SOCS7O14512 581 aa28.08■■■□□ 2.09
CLK1-211ENST00000481641 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.05■■■□□ 2.08
CLK1-211ENST00000481641 TRIM52Q96A61 297 aa28.05■■■□□ 2.08
CLK1-211ENST00000481641 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CLK1-211ENST00000481641 MSH6P52701 1360 aa28.03■■■□□ 2.08
CLK1-211ENST00000481641 HFM1A2PYH4 1435 aa28.02■■■□□ 2.08
CLK1-211ENST00000481641 CLTCL1P53675 1640 aa28.01■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 DIP2AQ14689 1571 aa28■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 PTPRUQ92729 1446 aa27.98■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 TRPM2O94759 1503 aa27.97■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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CLK1-211ENST00000481641 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.96■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 PIK3R4Q99570 1358 aa27.96■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.96■■■□□ 2.07
CLK1-211ENST00000481641 C14orf37Q86TY3 774 aa27.95■■■□□ 2.06
CLK1-211ENST00000481641 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
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CLK1-211ENST00000481641 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.91■■■□□ 2.06
CLK1-211ENST00000481641 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.91■■■□□ 2.06
CLK1-211ENST00000481641 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.9■■■□□ 2.06
CLK1-211ENST00000481641 METP08581 1390 aa27.88■■■□□ 2.05
CLK1-211ENST00000481641 FOXD1Q16676 465 aa27.88■■■□□ 2.05
CLK1-211ENST00000481641 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CLK1-211ENST00000481641 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.86■■■□□ 2.05
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CLK1-211ENST00000481641 PHLPP1O60346 1717 aa27.83■■■□□ 2.05
CLK1-211ENST00000481641 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.82■■■□□ 2.04
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CLK1-211ENST00000481641 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.75■■■□□ 2.03
CLK1-211ENST00000481641 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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CLK1-211ENST00000481641 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.67■■■□□ 2.02
CLK1-211ENST00000481641 MST1RQ04912 1400 aa27.67■■■□□ 2.02
CLK1-211ENST00000481641 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.67■■■□□ 2.02
CLK1-211ENST00000481641 POTEAQ6S8J7 498 aa27.66■■■□□ 2.02
CLK1-211ENST00000481641 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.66■■■□□ 2.02
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CLK1-211ENST00000481641 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.65■■■□□ 2.02
CLK1-211ENST00000481641 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.64■■■□□ 2.02
CLK1-211ENST00000481641 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.63■■■□□ 2.01
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CLK1-211ENST00000481641 SHPRHQ149N8 1683 aa27.56■■■□□ 2
CLK1-211ENST00000481641 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.56■■■□□ 2
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CLK1-211ENST00000481641 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.54■■■□□ 2
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CLK1-211ENST00000481641 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CLK1-211ENST00000481641 STK26Q9P289 416 aa27.53■■■□□ 2
CLK1-211ENST00000481641 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.51■■□□□ 1.99
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CLK1-211ENST00000481641 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CLK1-211ENST00000481641 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.48■■□□□ 1.99
CLK1-211ENST00000481641 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CLK1-211ENST00000481641 PIK3C2GO75747 1445 aa27.46■■□□□ 1.99
CLK1-211ENST00000481641 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.43■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.42■■□□□ 1.98
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