RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469137.5

LIN7B-204, Transcript of lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component, human

TSL 2

Gene LIN7B, Length 1,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIN7B-204	ENST00000469137	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.38	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.36	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.35	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.35	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.35	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.34	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.32	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.32	■■■■■ 4.53
LIN7B-204	ENST00000469137	ITGAE	P38570	1179 aa		43.31	■■■■■ 4.52
LIN7B-204	ENST00000469137	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
LIN7B-204	ENST00000469137	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
LIN7B-204	ENST00000469137	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
LIN7B-204	ENST00000469137	NUP155	O75694	1391 aa		43.28	■■■■■ 4.52
LIN7B-204	ENST00000469137	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
LIN7B-204	ENST00000469137	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.23	■■■■■ 4.51
LIN7B-204	ENST00000469137	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.23	■■■■■ 4.51
LIN7B-204	ENST00000469137	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
LIN7B-204	ENST00000469137	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
LIN7B-204	ENST00000469137	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	43.2	■■■■■ 4.51
LIN7B-204	ENST00000469137	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
LIN7B-204	ENST00000469137	MSH6	P52701	1360 aa		43.14	■■■■■ 4.5
LIN7B-204	ENST00000469137	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.13	■■■■■ 4.5
LIN7B-204	ENST00000469137	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.13	■■■■■ 4.49
LIN7B-204	ENST00000469137	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		43.13	■■■■■ 4.49
LIN7B-204	ENST00000469137	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.1	■■■■■ 4.49
LIN7B-204	ENST00000469137	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
LIN7B-204	ENST00000469137	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.05	■■■■■ 4.48
LIN7B-204	ENST00000469137	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
LIN7B-204	ENST00000469137	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.03	■■■■■ 4.48
LIN7B-204	ENST00000469137	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.01	■■■■■ 4.48
LIN7B-204	ENST00000469137	TRPM2	O94759	1503 aa		42.98	■■■■■ 4.47
LIN7B-204	ENST00000469137	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.96	■■■■■ 4.47
LIN7B-204	ENST00000469137	NAIP	Q13075	1403 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LIN7B-204	ENST00000469137	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.9	■■■■■ 4.46
LIN7B-204	ENST00000469137	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.88	■■■■■ 4.46
LIN7B-204	ENST00000469137	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LIN7B-204	ENST00000469137	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
LIN7B-204	ENST00000469137	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LIN7B-204	ENST00000469137	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LIN7B-204	ENST00000469137	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
LIN7B-204	ENST00000469137	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	KIF1B	O60333	1816 aa		42.8	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.8	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.78	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	ATF3	P18847	181 aa		42.77	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
LIN7B-204	ENST00000469137	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.75	■■■■■ 4.43
LIN7B-204	ENST00000469137	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.74	■■■■■ 4.43
LIN7B-204	ENST00000469137	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
LIN7B-204	ENST00000469137	DCC	P43146	1447 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LIN7B-204	ENST00000469137	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.68	■■■■■ 4.42
LIN7B-204	ENST00000469137	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
LIN7B-204	ENST00000469137	MET	P08581	1390 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LIN7B-204	ENST00000469137	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
LIN7B-204	ENST00000469137	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.54	■■■■■ 4.4
LIN7B-204	ENST00000469137	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.54	■■■■■ 4.4
LIN7B-204	ENST00000469137	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
LIN7B-204	ENST00000469137	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.53	■■■■■ 4.4
LIN7B-204	ENST00000469137	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.53	■■■■■ 4.4
LIN7B-204	ENST00000469137	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.52	■■■■■ 4.4
LIN7B-204	ENST00000469137	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.5	■■■■■ 4.39
LIN7B-204	ENST00000469137	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.49	■■■■■ 4.39
LIN7B-204	ENST00000469137	MST1R	Q04912	1400 aa		42.49	■■■■■ 4.39
LIN7B-204	ENST00000469137	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
LIN7B-204	ENST00000469137	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.48	■■■■■ 4.39
LIN7B-204	ENST00000469137	PPL	O60437	1756 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LIN7B-204	ENST00000469137	LRP6	O75581	1613 aa		42.44	■■■■■ 4.38
LIN7B-204	ENST00000469137	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.43	■■■■■ 4.38
LIN7B-204	ENST00000469137	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.43	■■■■■ 4.38
LIN7B-204	ENST00000469137	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
LIN7B-204	ENST00000469137	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.36	■■■■■ 4.37
LIN7B-204	ENST00000469137	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.35	■■■■■ 4.37
LIN7B-204	ENST00000469137	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.33	■■■■■ 4.37
LIN7B-204	ENST00000469137	FOXD1	Q16676	465 aa		42.31	■■■■■ 4.36
LIN7B-204	ENST00000469137	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.3	■■■■■ 4.36
LIN7B-204	ENST00000469137	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.29	■■■■■ 4.36
LIN7B-204	ENST00000469137	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
LIN7B-204	ENST00000469137	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.25	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.24	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.2	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	LAMC1	P11047	1609 aa		42.2	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.2	■■■■■ 4.35
LIN7B-204	ENST00000469137	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.18	■■■■■ 4.34
LIN7B-204	ENST00000469137	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
LIN7B-204	ENST00000469137	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LIN7B-204	ENST00000469137	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LIN7B-204	ENST00000469137	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.14	■■■■■ 4.34
LIN7B-204	ENST00000469137	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.11	■■■■■ 4.33
LIN7B-204	ENST00000469137	TECPR2	O15040	1411 aa		42.07	■■■■■ 4.33
LIN7B-204	ENST00000469137	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.07	■■■■■ 4.33
LIN7B-204	ENST00000469137	AFF2	P51816	1311 aa		42.05	■■■■■ 4.32
LIN7B-204	ENST00000469137	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.04	■■■■■ 4.32
LIN7B-204	ENST00000469137	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.04	■■■■■ 4.32

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