RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADGRL2O95490 1459 aa18.04■□□□□ 0.48
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.03■□□□□ 0.48
UBE2Q1-202ENST00000467683 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.03■□□□□ 0.48
UBE2Q1-202ENST00000467683 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.02■□□□□ 0.48
UBE2Q1-202ENST00000467683 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZFYVE9O95405 1425 aa17.99■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 POTEAQ6S8J7 498 aa17.99■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 BCANQ96GW7 911 aa17.99■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.99■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 JCADQ9P266 1359 aa17.99■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.98■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa17.98■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLAIN2Q9P270 581 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 DIP2AQ14689 1571 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2Q1-202ENST00000467683 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 UNC13BO14795 1591 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 TBX22Q9Y458 520 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 SHPRHQ149N8 1683 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 PIK3R4Q99570 1358 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 E9PCH4 1651 aa17.9■□□□□ 0.46
UBE2Q1-202ENST00000467683 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.88■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRPM2O94759 1503 aa17.88■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.87■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 C14orf37Q86TY3 774 aa17.87■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa17.87■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRP6O75581 1613 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATF3P18847 181 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 DCCP43146 1447 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 ROCK1Q13464 1354 aa17.81■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 NHSL1Q5SYE7 1610 aa17.79■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2Q1-202ENST00000467683 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 BRINP3Q76B58 766 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 PTPRUQ92729 1446 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 RXRBP28702 533 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRIM52Q96A61 297 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 NUP155O75694 1391 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 MST1RQ04912 1400 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2Q1-202ENST00000467683 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIF1BO60333 1816 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 AFF2P51816 1311 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 LAMC1P11047 1609 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
UBE2Q1-202ENST00000467683 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 METP08581 1390 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 PNPLA6Q8IY17 1366 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 CLTCL1P53675 1640 aa17.63■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 RGS12O14924 1447 aa17.62■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 PTCH1Q13635 1447 aa17.61■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 C8orf37Q96NL8 207 aa17.6■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 C1orf167Q5SNV9 1468 aa17.58■□□□□ 0.41
UBE2Q1-202ENST00000467683 NGLY1Q96IV0 654 aa17.58■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 ITGAEP38570 1179 aa17.57■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa17.56■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.54■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 HFM1A2PYH4 1435 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPLO60437 1756 aa17.53■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 FOXD1Q16676 465 aa17.52■□□□□ 0.4
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADAMTS2O95450 1211 aa17.51■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 EP400Q96L91 3159 aa17.51■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.51■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.49■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms