RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.36■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 ALKQ9UM73 1620 aa40.35■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 KCNA6P17658 529 aa40.35■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.34■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 HFM1A2PYH4 1435 aa40.33■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 BCANQ96GW7 911 aa40.32■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
ODC1-204ENST00000446285 NWD1Q149M9 1564 aa40.31■■■■■ 4.04
ODC1-204ENST00000446285 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.29■■■■■ 4.04
ODC1-204ENST00000446285 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
ODC1-204ENST00000446285 HSPA1LP34931 641 aa40.24■■■■■ 4.03
ODC1-204ENST00000446285 DIP2AQ14689 1571 aa40.21■■■■■ 4.03
ODC1-204ENST00000446285 TMEM94Q12767 1356 aa40.21■■■■■ 4.03
ODC1-204ENST00000446285 TBX22Q9Y458 520 aa40.2■■■■■ 4.03
ODC1-204ENST00000446285 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
ODC1-204ENST00000446285 TRPM2O94759 1503 aa40.19■■■■■ 4.02
ODC1-204ENST00000446285 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
ODC1-204ENST00000446285 PIK3R4Q99570 1358 aa40.13■■■■■ 4.02
ODC1-204ENST00000446285 TRIM52Q96A61 297 aa40.13■■■■■ 4.01
ODC1-204ENST00000446285 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.13■■■■■ 4.01
ODC1-204ENST00000446285 CLTCL1P53675 1640 aa40.11■■■■■ 4.01
ODC1-204ENST00000446285 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
ODC1-204ENST00000446285 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
ODC1-204ENST00000446285 KIF1BO60333 1816 aa40.07■■■■■ 4.01
ODC1-204ENST00000446285 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
ODC1-204ENST00000446285 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.03■■■■■ 4
ODC1-204ENST00000446285 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.03■■■■■ 4
ODC1-204ENST00000446285 MSH6P52701 1360 aa40.03■■■■■ 4
ODC1-204ENST00000446285 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
ODC1-204ENST00000446285 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.02■■■■■ 4
ODC1-204ENST00000446285 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.97■■■■□ 3.99
ODC1-204ENST00000446285 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
ODC1-204ENST00000446285 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.97■■■■□ 3.99
ODC1-204ENST00000446285 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
ODC1-204ENST00000446285 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
ODC1-204ENST00000446285 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.89■■■■□ 3.98
ODC1-204ENST00000446285 ILDR2Q71H61 639 aa39.89■■■■□ 3.98
ODC1-204ENST00000446285 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.87■■■■□ 3.97
ODC1-204ENST00000446285 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
ODC1-204ENST00000446285 PTPRUQ92729 1446 aa39.85■■■■□ 3.97
ODC1-204ENST00000446285 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.84■■■■□ 3.97
ODC1-204ENST00000446285 C14orf37Q86TY3 774 aa39.83■■■■□ 3.97
ODC1-204ENST00000446285 SLAIN2Q9P270 581 aa39.83■■■■□ 3.97
ODC1-204ENST00000446285 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.8■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.78■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.78■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.76■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.76■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 METP08581 1390 aa39.76■■■■□ 3.96
ODC1-204ENST00000446285 PPLO60437 1756 aa39.75■■■■□ 3.95
ODC1-204ENST00000446285 ATF3P18847 181 aa39.73■■■■□ 3.95
ODC1-204ENST00000446285 DCCP43146 1447 aa39.73■■■■□ 3.95
ODC1-204ENST00000446285 FOXD1Q16676 465 aa39.72■■■■□ 3.95
ODC1-204ENST00000446285 SOCS7O14512 581 aa39.69■■■■□ 3.94
ODC1-204ENST00000446285 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
ODC1-204ENST00000446285 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
ODC1-204ENST00000446285 PHLPP1O60346 1717 aa39.67■■■■□ 3.94
ODC1-204ENST00000446285 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.62■■■■□ 3.93
ODC1-204ENST00000446285 PTCH1Q13635 1447 aa39.6■■■■□ 3.93
ODC1-204ENST00000446285 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.59■■■■□ 3.93
ODC1-204ENST00000446285 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.58■■■■□ 3.93
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.58■■■■□ 3.93
ODC1-204ENST00000446285 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.58■■■■□ 3.93
ODC1-204ENST00000446285 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
ODC1-204ENST00000446285 IFT172Q9UG01 1749 aa39.56■■■■□ 3.92
ODC1-204ENST00000446285 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
ODC1-204ENST00000446285 JCADQ9P266 1359 aa39.54■■■■□ 3.92
ODC1-204ENST00000446285 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.52■■■■□ 3.92
ODC1-204ENST00000446285 RGL3Q3MIN7 710 aa39.5■■■■□ 3.91
ODC1-204ENST00000446285 MST1RQ04912 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
ODC1-204ENST00000446285 BRINP3Q76B58 766 aa39.47■■■■□ 3.91
ODC1-204ENST00000446285 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.46■■■■□ 3.91
ODC1-204ENST00000446285 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.46■■■■□ 3.91
ODC1-204ENST00000446285 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.45■■■■□ 3.91
ODC1-204ENST00000446285 HRCP23327 699 aa39.42■■■■□ 3.9
ODC1-204ENST00000446285 PIK3C2GO75747 1445 aa39.4■■■■□ 3.9
ODC1-204ENST00000446285 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.38■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 SHPRHQ149N8 1683 aa39.38■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.37■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 TECPR2O15040 1411 aa39.34■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 MYOM2P54296 1465 aa39.33■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.32■■■■□ 3.89
ODC1-204ENST00000446285 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
ODC1-204ENST00000446285 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.31■■■■□ 3.88
ODC1-204ENST00000446285 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.3■■■■□ 3.88
ODC1-204ENST00000446285 LAMC1P11047 1609 aa39.29■■■■□ 3.88
ODC1-204ENST00000446285 ABCC11Q96J66 1382 aa39.28■■■■□ 3.88
ODC1-204ENST00000446285 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.26■■■■□ 3.88
ODC1-204ENST00000446285 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
ODC1-204ENST00000446285 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
ODC1-204ENST00000446285 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
ODC1-204ENST00000446285 STK26Q9P289 416 aa39.21■■■■□ 3.87
ODC1-204ENST00000446285 LRP6O75581 1613 aa39.2■■■■□ 3.87
ODC1-204ENST00000446285 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.19■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.6 ms