RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 MSH6P52701 1360 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 NOS1P29475 1434 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-210ENST00000442481 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 ADGRL2O95490 1459 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 PHLPP1O60346 1717 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 SLAIN2Q9P270 581 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 ZFYVE9O95405 1425 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.96■□□□□ 0.47
PRAME-210ENST00000442481 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 JCADQ9P266 1359 aa17.95■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.95■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.93■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.93■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 LRP6O75581 1613 aa17.92■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 C14orf37Q86TY3 774 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 TBX22Q9Y458 520 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 DIP2AQ14689 1571 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 PIK3R4Q99570 1358 aa17.9■□□□□ 0.46
PRAME-210ENST00000442481 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.89■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.88■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 UNC13BO14795 1591 aa17.87■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 ATF3P18847 181 aa17.87■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa17.87■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.85■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 SHPRHQ149N8 1683 aa17.83■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 TRPM2O94759 1503 aa17.83■□□□□ 0.45
PRAME-210ENST00000442481 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 ROCK1Q13464 1354 aa17.82■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 TRIM52Q96A61 297 aa17.82■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 E9PCH4 1651 aa17.81■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 DCCP43146 1447 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 PTPRUQ92729 1446 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 BRINP3Q76B58 766 aa17.78■□□□□ 0.44
PRAME-210ENST00000442481 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.76■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 NUP155O75694 1391 aa17.76■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa17.74■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 RXRBP28702 533 aa17.74■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.72■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 NHSL1Q5SYE7 1610 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 MST1RQ04912 1400 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-210ENST00000442481 AFF2P51816 1311 aa17.71■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa17.69■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 ITGAEP38570 1179 aa17.67■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 METP08581 1390 aa17.66■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 RGS12O14924 1447 aa17.66■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.65■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 PNPLA6Q8IY17 1366 aa17.65■□□□□ 0.42
PRAME-210ENST00000442481 C8orf37Q96NL8 207 aa17.63■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.63■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 KIF1BO60333 1816 aa17.59■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.59■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 FOXD1Q16676 465 aa17.59■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 NGLY1Q96IV0 654 aa17.59■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 PTCH1Q13635 1447 aa17.58■□□□□ 0.41
PRAME-210ENST00000442481 C1orf167Q5SNV9 1468 aa17.57■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS2O95450 1211 aa17.57■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 CLTCL1P53675 1640 aa17.57■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 LAMC1P11047 1609 aa17.56■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.53■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 ORAI2Q96SN7 254 aa17.53■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 HFM1A2PYH4 1435 aa17.52■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.52■□□□□ 0.4
PRAME-210ENST00000442481 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa17.52■□□□□ 0.39
PRAME-210ENST00000442481 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.52■□□□□ 0.39
PRAME-210ENST00000442481 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.52■□□□□ 0.39
PRAME-210ENST00000442481 USP21Q9UK80 565 aa17.5■□□□□ 0.39
PRAME-210ENST00000442481 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
PRAME-210ENST00000442481 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
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