RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427786.1

PPP1CB-206, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PPP1CB, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-206ENST00000427786 TRPM2O94759 1503 aa29.66■■■□□ 2.34
PPP1CB-206ENST00000427786 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.65■■■□□ 2.34
PPP1CB-206ENST00000427786 CLTCL1P53675 1640 aa29.63■■■□□ 2.33
PPP1CB-206ENST00000427786 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP1CB-206ENST00000427786 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 DIP2AQ14689 1571 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 TOM1O60784 492 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 KCNA6P17658 529 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
PPP1CB-206ENST00000427786 KIF1BO60333 1816 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 TMEM94Q12767 1356 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 TRIM52Q96A61 297 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 PIP4K2BP78356 416 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 TBX22Q9Y458 520 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP1CB-206ENST00000427786 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
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PPP1CB-206ENST00000427786 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PPP1CB-206ENST00000427786 PIK3R4Q99570 1358 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP1CB-206ENST00000427786 BCANQ96GW7 911 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP1CB-206ENST00000427786 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PPP1CB-206ENST00000427786 HSPA1LP34931 641 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP1CB-206ENST00000427786 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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PPP1CB-206ENST00000427786 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
PPP1CB-206ENST00000427786 PPLO60437 1756 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP1CB-206ENST00000427786 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP1CB-206ENST00000427786 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PPP1CB-206ENST00000427786 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
PPP1CB-206ENST00000427786 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP1CB-206ENST00000427786 FOXD1Q16676 465 aa29.3■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.3■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.29■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.29■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.29■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 IFT172Q9UG01 1749 aa29.28■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 MSH6P52701 1360 aa29.27■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 METP08581 1390 aa29.26■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.26■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
PPP1CB-206ENST00000427786 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
PPP1CB-206ENST00000427786 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.26■■■□□ 2.27
PPP1CB-206ENST00000427786 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PPP1CB-206ENST00000427786 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.25■■■□□ 2.27
PPP1CB-206ENST00000427786 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.22■■■□□ 2.27
PPP1CB-206ENST00000427786 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.22■■■□□ 2.27
PPP1CB-206ENST00000427786 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.19■■■□□ 2.26
PPP1CB-206ENST00000427786 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
PPP1CB-206ENST00000427786 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP1CB-206ENST00000427786 DCCP43146 1447 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP1CB-206ENST00000427786 PTCH1Q13635 1447 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 SLAIN2Q9P270 581 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 ILDR2Q71H61 639 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 PHLPP1O60346 1717 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PPP1CB-206ENST00000427786 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.07■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 PIK3C2GO75747 1445 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 C14orf37Q86TY3 774 aa29.06■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 HRCP23327 699 aa29.05■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 MST1RQ04912 1400 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 RGL3Q3MIN7 710 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 MYOM2P54296 1465 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP1CB-206ENST00000427786 ATF3P18847 181 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP1CB-206ENST00000427786 TECPR2O15040 1411 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP1CB-206ENST00000427786 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.98■■■□□ 2.23
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PPP1CB-206ENST00000427786 BRINP3Q76B58 766 aa28.94■■■□□ 2.22
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PPP1CB-206ENST00000427786 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.92■■■□□ 2.22
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PPP1CB-206ENST00000427786 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.88■■■□□ 2.21
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PPP1CB-206ENST00000427786 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PPP1CB-206ENST00000427786 ADGRB1O14514 1584 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP1CB-206ENST00000427786 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP1CB-206ENST00000427786 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PPP1CB-206ENST00000427786 LRP6O75581 1613 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP1CB-206ENST00000427786 SOCS7O14512 581 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP1CB-206ENST00000427786 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PPP1CB-206ENST00000427786 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.8■■■□□ 2.2
PPP1CB-206ENST00000427786 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.78■■■□□ 2.2
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