RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.09■■□□□ 1.29
NOMO3-202ENST00000399336 BCAR3O75815 825 aa23.07■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 RIPK4P57078 832 aa23.07■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.07■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 OSCARQ8IYS5 282 aa23.05■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 USP35Q9P2H5 1018 aa23.05■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 MSH5O43196 834 aa23.04■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 SKAP1Q86WV1 359 aa23.04■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.04■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.04■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 PLCB2Q00722 1185 aa23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 NGEFQ8N5V2 710 aa23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 KCNJ4P48050 445 aa23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.02■■□□□ 1.28
NOMO3-202ENST00000399336 ERBINQ96RT1 1412 aa23.01■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 ARID3AQ99856 593 aa23.01■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 HMOX1P09601 288 aa23■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 STK31Q9BXU1 1019 aa22.99■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 GRIN2AQ12879 1464 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 COG3Q96JB2 828 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 GSE1Q14687 1217 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 GBP4Q96PP9 640 aa22.97■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 BACH2Q9BYV9 841 aa22.97■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 AMPHP49418 695 aa22.97■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.96■■□□□ 1.27
NOMO3-202ENST00000399336 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.95■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.94■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 LNPKQ9C0E8 428 aa22.94■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 MCCP23508 829 aa22.93■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.92■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 NFKBIBQ15653 356 aa22.92■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 FGD1P98174 961 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 RAPGEF3O95398 923 aa22.89■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
NOMO3-202ENST00000399336 HMMRO75330 724 aa22.89■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 CFAP44Q96MT7 982 aa22.89■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 EID1Q9Y6B2 187 aa22.89■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.87■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 PRAM1Q96QH2 718 aa22.87■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 NECTIN2Q92692 538 aa22.84■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 PDE3AQ14432 1141 aa22.84■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 IL27Q8NEV9 243 aa22.84■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 SLFN5Q08AF3 891 aa22.83■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.83■■□□□ 1.25
NOMO3-202ENST00000399336 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 PRKAR2BP31323 418 aa22.82■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 KIF16BQ96L93 1317 aa22.81■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 WWC1Q8IX03 1113 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.79■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 CABP1Q9NZU7 370 aa22.79■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.78■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 RILPL2Q969X0 211 aa22.77■■□□□ 1.24
NOMO3-202ENST00000399336 GNAI1P63096 354 aa22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 ST18O60284 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 KIF14Q15058 1648 aa22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 ATP10BO94823 1461 aa22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.71■■□□□ 1.23
NOMO3-202ENST00000399336 CDK19Q9BWU1 502 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms