RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJB2P25686 324 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CLCN1P35523 988 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF3Q9H094 633 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0G2JS52 829 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 MS4A1P11836 297 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IFFO2Q5TF58 517 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS20O76081 388 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM117AQ9C073 453 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-202ENST00000370826 IL27Q8NEV9 243 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SULF1Q8IWU6 871 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CD46P15529 392 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC10A3P09131 477 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 BCAMP50895 628 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLF2Q8IX21 1173 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 LRCH3Q96II8 777 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A3P48751 1232 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 RDH13Q8NBN7 331 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF40O75150 1001 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 GCGRP47871 477 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 CFHP08603 1231 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP4CP60510 307 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM4AO75164 1064 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZNB5 142 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 NECTIN2Q92692 538 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 WBP1LQ9NX94 342 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-202ENST00000370826 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 GOPCQ9HD26 462 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 USP46P62068 366 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNC4Q03721 635 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 APLP1P51693 650 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 FUT2Q10981 343 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA2O43364 376 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFV2P19404 249 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR14Q9BWN1 585 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 SPTLC1O15269 473 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6V1AP38606 617 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-202ENST00000370826 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GJA5P36382 358 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MORN1Q5T089 497 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-CQ95604 372 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCA2AQ02747 115 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 FDX1P10109 184 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.28□□□□□ -1.08
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