RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.19■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.17■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 NLRP1Q9C000 1473 aa25.16■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 STAC3Q96MF2 364 aa25.16■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.16■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.15■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.15■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.14■■□□□ 1.62
LTV1-201ENST00000367576 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 PTPRMP28827 1452 aa25.12■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.12■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 USP47Q96K76 1375 aa25.12■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 PIK3C2GO75747 1445 aa25.11■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.11■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.08■■□□□ 1.61
LTV1-201ENST00000367576 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.07■■□□□ 1.6
LTV1-201ENST00000367576 LAMC1P11047 1609 aa25.06■■□□□ 1.6
LTV1-201ENST00000367576 ZFYVE9O95405 1425 aa25.06■■□□□ 1.6
LTV1-201ENST00000367576 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LTV1-201ENST00000367576 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.04■■□□□ 1.6
LTV1-201ENST00000367576 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 IQGAP1P46940 1657 aa24.99■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.98■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.97■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.97■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.97■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 ADGRB1O14514 1584 aa24.96■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.95■■□□□ 1.59
LTV1-201ENST00000367576 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 SLIT1O75093 1534 aa24.95■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 ALKQ9UM73 1620 aa24.95■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.94■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 LTKP29376 864 aa24.93■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.93■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.93■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 BCANQ96GW7 911 aa24.93■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 EID1Q9Y6B2 187 aa24.91■■□□□ 1.58
LTV1-201ENST00000367576 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.89■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.89■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.87■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 STK26Q9P289 416 aa24.86■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.86■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 CCDC7Q96M83 1385 aa24.86■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.85■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 TESK2Q96S53 571 aa24.83■■□□□ 1.57
LTV1-201ENST00000367576 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.82■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 METP08581 1390 aa24.82■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.8■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.8■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.77■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.77■■□□□ 1.56
LTV1-201ENST00000367576 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 MED14O60244 1454 aa24.74■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 TMF1P82094 1093 aa24.74■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.72■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 PRAM1Q96QH2 718 aa24.72■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 HSPA2P54652 639 aa24.71■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 DIP2AQ14689 1571 aa24.71■■□□□ 1.55
LTV1-201ENST00000367576 POGKQ9P215 609 aa24.7■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 DLC1Q96QB1 1528 aa24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 TBX22Q9Y458 520 aa24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 PTPRUQ92729 1446 aa24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 ABCC11Q96J66 1382 aa24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.68■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.67■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.66■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.66■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 CPS1P31327 1500 aa24.65■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
LTV1-201ENST00000367576 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.63■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 TECPR2O15040 1411 aa24.63■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.62■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 MIER1Q8N108 512 aa24.61■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.61■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 CDCA8Q53HL2 280 aa24.59■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.58■■□□□ 1.53
LTV1-201ENST00000367576 EVC2Q86UK5 1308 aa24.56■■□□□ 1.52
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