RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 HFM1A2PYH4 1435 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXC6-201ENST00000243108 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXC6-201ENST00000243108 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXC6-201ENST00000243108 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXC6-201ENST00000243108 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXC6-201ENST00000243108 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HOXC6-201ENST00000243108 TOM1O60784 492 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXC6-201ENST00000243108 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXC6-201ENST00000243108 PIP4K2BP78356 416 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXC6-201ENST00000243108 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXC6-201ENST00000243108 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
HOXC6-201ENST00000243108 CLTCL1P53675 1640 aa25.7■■□□□ 1.71
HOXC6-201ENST00000243108 KCNA6P17658 529 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 NWD1Q149M9 1564 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 BCANQ96GW7 911 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 TRPM2O94759 1503 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM52Q96A61 297 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 HSPA1LP34931 641 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM94Q12767 1356 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXC6-201ENST00000243108 TBX22Q9Y458 520 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 KIF1BO60333 1816 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 DIP2AQ14689 1571 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXC6-201ENST00000243108 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC6-201ENST00000243108 FOXD1Q16676 465 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXC6-201ENST00000243108 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXC6-201ENST00000243108 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXC6-201ENST00000243108 PTPRUQ92729 1446 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXC6-201ENST00000243108 PIK3R4Q99570 1358 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 ILDR2Q71H61 639 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 METP08581 1390 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC6-201ENST00000243108 MSH6P52701 1360 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 PPLO60437 1756 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXC6-201ENST00000243108 SLAIN2Q9P270 581 aa25.39■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.36■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 C14orf37Q86TY3 774 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 IFT172Q9UG01 1749 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.34■■□□□ 1.65
HOXC6-201ENST00000243108 RGL3Q3MIN7 710 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 PHLPP1O60346 1717 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 ATF3P18847 181 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXC6-201ENST00000243108 DCCP43146 1447 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 PTCH1Q13635 1447 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 MST1RQ04912 1400 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC6-201ENST00000243108 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 BRINP3Q76B58 766 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 PIK3C2GO75747 1445 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 SOCS7O14512 581 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 JCADQ9P266 1359 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 MYOM2P54296 1465 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 STK26Q9P289 416 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 TECPR2O15040 1411 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXC6-201ENST00000243108 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.07■■□□□ 1.6
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