RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.5■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 PPLO60437 1756 aa25.5■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.49■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.48■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.48■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.47■■□□□ 1.67
CBX1-201ENST00000225603 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.44■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.43■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 USP47Q96K76 1375 aa25.43■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 PIK3C2GO75747 1445 aa25.41■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 NLRP1Q9C000 1473 aa25.4■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CBX1-201ENST00000225603 ZFYVE9O95405 1425 aa25.38■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.37■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.37■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.35■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 PTPRMP28827 1452 aa25.34■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 LAMC1P11047 1609 aa25.33■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CBX1-201ENST00000225603 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.32■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.32■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.32■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.29■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 MIER1Q8N108 512 aa25.28■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
CBX1-201ENST00000225603 ADGRB1O14514 1584 aa25.26■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.26■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 LTKP29376 864 aa25.25■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 IQGAP1P46940 1657 aa25.25■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.24■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.24■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.21■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.21■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 SLIT1O75093 1534 aa25.21■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.21■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 ALKQ9UM73 1620 aa25.21■■□□□ 1.63
CBX1-201ENST00000225603 TESK2Q96S53 571 aa25.2■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 CCDC7Q96M83 1385 aa25.19■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.19■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.18■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.18■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 EID1Q9Y6B2 187 aa25.16■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CBX1-201ENST00000225603 BCANQ96GW7 911 aa25.14■■□□□ 1.61
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CBX1-201ENST00000225603 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.13■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.11■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 METP08581 1390 aa25.11■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.11■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.1■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CBX1-201ENST00000225603 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.07■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 TMF1P82094 1093 aa25.05■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 MED14O60244 1454 aa25.05■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.05■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CBX1-201ENST00000225603 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 PRAM1Q96QH2 718 aa25■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 ABCC11Q96J66 1382 aa25■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 TBX22Q9Y458 520 aa24.99■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.99■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.97■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 PTPRUQ92729 1446 aa24.96■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.96■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 POGKQ9P215 609 aa24.96■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.96■■□□□ 1.59
CBX1-201ENST00000225603 DLC1Q96QB1 1528 aa24.95■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 HSPA2P54652 639 aa24.94■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 TECPR2O15040 1411 aa24.93■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 SLC24A1O60721 1099 aa24.92■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 DIP2AQ14689 1571 aa24.92■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.9■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 CDCA8Q53HL2 280 aa24.9■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.9■■□□□ 1.58
CBX1-201ENST00000225603 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.89■■□□□ 1.57
CBX1-201ENST00000225603 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.89■■□□□ 1.57
CBX1-201ENST00000225603 SIRT1Q96EB6 747 aa24.89■■□□□ 1.57
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