RNA–Protein interactions for RNA: YNL247W

YNL247W, Transcript of Cysteinyl-tRNA synthetase, yeast

Gene YNL247W, Length 2,304 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL247W	YNL247W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	PET54	P10834	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	TCA17	P32613	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	OM14	P38325	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	DOG1	P38774	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	SPL2	P38839	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	NVJ1	P38881	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	MOG1	P47123	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	AGE2	P40529	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	PRM8	P53174	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	COS6	P53344	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	DYN3	Q04949	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YPS3	Q12303	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	SPO14	P36126	1683 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	BUD3	P25558	1636 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	ILM1	P47155	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	FLC3	P53121	802 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YGR042W	P53227	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	EMI1	Q04406	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	PEX11	Q12462	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	ZRT3	P34240	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	IGD1	P43598	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YGL262W	P53054	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	COG5	P53951	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	TIM22	Q12328	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	ATG5	Q12380	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	PTM1	P32857	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	SMP1	P38128	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YAP3	P38749	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL247W	YNL247W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YCR023C	P25351	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	COQ5	P49017	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	HST4	P53688	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SEC22	P22214	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YGR050C	P53231	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	FMP32	P43557	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YJL028W	P47062	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	HSK3	P69852	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	CDC7	P06243	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YHL044W	P38727	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YER189W	P40104	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	RPE1	P46969	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YGL204C	P53089	101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	DID2	P69771	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	ECM19	Q06011	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SIR2	P06700	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	CYC2	P38909	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SYS1	P41544	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YGL118C	P53132	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	ECM11	Q04110	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	AHC2	P25649	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	UPS2	P35200	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	MIC19	P43594	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YML108W	Q03759	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SNF2	P22082	1703 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SNF4	P12904	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SCO1	P23833	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	SLM6	P38343	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	DOG2	P38773	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	KRE9	P39005	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	EPT1	P22140	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	MAK3	Q03503	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	MHT1	Q12525	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	CNB1	P25296	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	RPB9	P27999	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	OPY1	P38271	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	RMD6	P39975	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL247W	YNL247W	AIM34	Q03673	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.3 ms