RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W SNO1Q03144 224 aa3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
YKR047WYKR047W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W VPS51P36116 164 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W POP4P38336 279 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W AST2P39945 430 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W RSM25P40496 264 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W RTC4P53850 401 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W FUS2Q05670 677 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W IGO2Q9P305 131 aa3.21□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YIL177CP40434 1758 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YJL225CP40889 1758 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W SRP14P38985 146 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YGR026WP53217 278 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YIP3P53633 176 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W NRK1P53915 240 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W PRM15Q03262 622 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W GRX8Q05926 109 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YPL162CQ12042 273 aa3.2□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W SIR2P06700 562 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9not detected
YKR047WYKR047W MAG1P22134 296 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W VMA11P32842 164 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W SKG1P36169 355 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YGL088WP53151 121 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W CAB4P53332 305 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W COG5P53951 403 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W ARO80Q04052 950 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W GGA1Q06336 557 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YLR036CQ07986 203 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W PRM7Q12459 698 aa3.19□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YLR156WP0CE96 114 aa3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YLR159WP0CE97 114 aa3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YLR161WP0CE98 114 aa3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W MIG1P27705 504 aa3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W SMD3P43321 101 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YOL024WQ08172 172 aa3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W AKR2Q12013 749 aa3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W CDC8P00572 216 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W PUT1P09368 476 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W CCA1P21269 546 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W TRX3P25372 127 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W TRR1P29509 319 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W UTP30P36144 274 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W CTR2P38865 189 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YNL184CP53876 108 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W PSF1Q12488 208 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa3.17□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W SEC17P32602 292 aa3.16□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W APJ1P53940 528 aa3.16□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W TRM12Q04235 462 aa3.16□□□□□ -1.9
YKR047WYKR047W REP2P03872 296 aa3.15□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W GLE2P40066 365 aa3.15□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YLR460CP54007 376 aa3.15□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YHL026CP38740 315 aa3.14□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SNX4P47057 423 aa3.14□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W DSK2P48510 373 aa3.14□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YDR249CQ03787 373 aa3.14□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MCP1Q12106 302 aa3.14□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YPR096CO13587 100 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MSW1P04803 379 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SNF4P12904 322 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W BET1P22804 142 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SCM4P32564 187 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SDH4P37298 181 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SPO73P40031 143 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W UBC12P52491 188 aa3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W CNB1P25296 175 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MNN5P46982 586 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YJL144WP47009 104 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YJR146WP47174 117 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YNL140CP53910 189 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W MHT1Q12525 324 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W URA5P13298 226 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W RPB3P16370 318 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YKR041WP36134 250 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YER076CP40049 302 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W YER121WP40076 114 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W AIF1P52923 378 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SLM2P53955 656 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SWP1Q02795 286 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR047WYKR047W SUE1Q06524 206 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.7 ms