RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W REC104P33323 182 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YKL102CP34249 101 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W SOR1P35497 357 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PAC2P39937 518 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PRE5P40302 234 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W LTP1P40347 161 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YJL068CP40363 299 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W FIS1P40515 155 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YPS6P40583 537 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W COQ5P49017 307 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W UBP8P50102 471 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YGR015CP53208 328 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W VHT1P53241 593 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W TEX1P53851 422 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MRPL19P53875 158 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W SKO1Q02100 647 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W SDH7Q04401 133 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MRX8Q05473 314 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W SOR2Q07786 357 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RAX2Q12465 1220 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W COX1P00401 534 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W CDC43P18898 376 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PCL2P25693 308 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ATS1P31386 333 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W TOA2P32774 122 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YSC83P32792 385 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W AIM26P32858 118 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YKL187CP34231 750 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W DAD2P36162 133 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W THI2P38141 450 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W REG2P38232 338 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W GTS1P40956 396 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ATG27P46989 271 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YGL262WP53054 175 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W NPY1P53164 384 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W TAM41P53230 385 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YNL140CP53910 189 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RNH201P53942 307 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W HLR1Q04429 423 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YMR252CQ04814 134 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YLR456WQ06199 204 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W SUE1Q06524 206 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PRM3Q08931 133 aa4.71□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W INO4P13902 151 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W DCG1P32460 244 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W THI80P35202 319 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W KKQ8P36004 724 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ECM33P38248 429 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W CTF8P38877 133 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PHS1P40857 217 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W NCE103P53615 221 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YNL034WP53963 612 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W CRZ1P53968 678 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W IRC15Q02733 499 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W TSA2Q04120 196 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ARA2Q04212 335 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W PAM18Q07914 168 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W NRT1Q08485 598 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MAK32P23060 363 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W TKL1P23254 680 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W CNE1P27825 502 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MRP49P32388 137 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YOR062CP36025 268 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W CBP4P37267 147 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W DOG1P38774 246 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W SRP14P38985 146 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ERG28P40030 148 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RRT5P43607 289 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W BNA2P47125 453 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W IBD2P53892 351 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RRT7Q07829 113 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ZPS1Q12512 249 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W GSC2P40989 1895 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ADH1P00330 348 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W DPM1P14020 267 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MCK1P21965 375 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W MIX23P38162 196 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ACA1P39970 489 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RPN11P43588 306 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W JJJ3P47138 172 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YLR460CP54007 376 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W INP1Q03694 420 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RSF1Q05043 376 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W COQ11Q05892 277 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ARR3Q06598 404 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W GAS5Q08193 484 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W YOR385WQ08909 290 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W USB1Q12208 290 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W COX10P21592 462 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3YKL125W ZRT1P32804 376 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.9 ms