RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604609.2

GDF15-205, Transcript of growth differentiation factor 15, human

TSL 3

Gene GDF15, Length 506 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GDF15-205	ENST00000604609	ERVFC1	P60507	584 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	BIRC3	Q13489	604 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ADGRE1	Q14246	886 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	KRT31	Q15323	416 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CCDC142	Q17RM4	750 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ZACN	Q401N2	412 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CD302	Q8IX05	232 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	DERA	Q9Y315	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	NME7	Q9Y5B8	376 aa		10.64	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	AP5Z1	O43299	807 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TNNC2	P02585	160 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ALDH2	P05091	517 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CYP3A5	P20815	502 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RAP1GAP	P47736	663 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FMO5	P49326	533 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	KLK7	P49862	253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	MXI1	P50539	228 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	LRMP	Q12912	555 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	NCOA4	Q13772	614 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FUT10	Q6P4F1	479 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	KAT5	Q92993	513 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	VPS16	Q9H269	839 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SPG21	Q9NZD8	308 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10.63	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	C2CD2L	O14523	706 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	IKBKB	O14920	756 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ADAM12	O43184	909 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TADA2A	O75478	443 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CDH8	P55286	799 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	LILRA4	P59901	499 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	MYL7	Q01449	175 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	GPM6B	Q13491	265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SURF1	Q15526	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	OSTM1	Q86WC4	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TATDN2	Q93075	761 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ARID3A	Q99856	593 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		10.62	□□□□□ -0.71
GDF15-205	ENST00000604609	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71

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