RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 H7C4K7 107 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXA9P31269 272 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CASP5P51878 434 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 POSTNQ15063 836 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 UVSSAQ2YD98 709 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ATL3Q6DD88 541 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 JADE1Q6IE81 842 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 APPL2Q8NEU8 664 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 BEST2Q8NFU1 509 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 DHX58Q96C10 678 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC27Q9C0I9 530 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 TNMDQ9H2S6 317 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CUEDC2Q9H467 287 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 TCHHQ07283 1943 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 NOTCH4Q99466 2003 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CCL16O15467 120 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 XYLBO75191 536 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ME1P48163 572 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ARPP19P56211 112 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ROR1Q01973 937 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ALCAMQ13740 583 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA1Q5VX52 437 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 IQUBQ8NA54 791 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ASIC4Q96FT7 647 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 MYADMQ96S97 322 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP45Q9UL16 551 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PCDHA7Q9UN72 937 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 POLIQ9UNA4 740 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR27A2RRH5 827 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 M0QZQ0 153 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 TBC1D4O60343 1298 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 NFICP08651 508 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ADSSP30520 456 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 AMPD3Q01432 767 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM132DQ14C87 1099 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF280DQ6N043 979 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ASB7Q9H672 318 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNK12Q9HB15 430 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 DERAQ9Y315 318 aa18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PPEF2O14830 753 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ABLIM3O94929 683 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 FSHRP23945 695 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ELF1P32519 619 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 NTHL1P78549 312 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL10Q7L3V2 364 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM9Q9C026 710 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-211ENST00000493436 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 POU2F2P09086 479 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ASIC1P78348 528 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TDGQ13569 410 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf57Q5W0N0 161 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FBXL6Q8N531 539 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SAAL1Q96ER3 474 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM206Q9H813 350 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 C2CD2Q9Y426 696 aa18.14■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PRRG1O14668 218 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 IL18RAPO95256 599 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LDHAP00338 332 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LAMP2P13473 410 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ATF2P15336 505 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 GARTP22102 1010 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LILRA4P59901 499 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 RESP18Q5W5W9 173 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP4-211ENST00000493436 TPGS2Q68CL5 300 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms