RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409915.8

SF3B1-202, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

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Gene SF3B1, Length 600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-202ENST00000409915 CHURC1Q8WUH1 139 aa5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 TRIB2Q92519 343 aa5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 ANKS1AQ92625 1134 aa5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 ATP6V1E2Q96A05 226 aa5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 DDX11Q96FC9 970 aa5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 UBXN10Q96LJ8 280 aa5□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 USP26Q9BXU7 913 aa5□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 ABCB4P21439 1286 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 ADCY2Q08462 1091 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 Q6ZUG5 572 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 KCT2Q8NC54 265 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 SOCS4Q8WXH5 440 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 DIO2Q92813 273 aa4.99□□□□□ -1.61
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SF3B1-202ENST00000409915 MMP19Q99542 508 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.99□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 ZNF236Q9UL36 1845 aa4.98□□□□□ -1.61
SF3B1-202ENST00000409915 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.98□□□□□ -1.61
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