RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 IFT81Q8WYA0 676 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 GANQ9H2C0 597 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFA10O95299 355 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 PIGRP01833 764 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 KRT13P13646 458 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 MORN1Q5T089 497 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 PPTC7Q8NI37 304 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 GLG1Q92896 1179 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.19e-8■□□□□ 10
HOXA3-201ENST00000317201 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 EHD2Q9NZN4 543 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TLL2Q9Y6L7 1015 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 NPTXRO95502 500 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 USP46P62068 366 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 KRT83P78385 493 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 IER5Q5VY09 327 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 FAM81BQ96LP2 452 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 FBXL18Q96ME1 805 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CHP1Q99653 195 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 NACA2Q9H009 215 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 MCM3APO60318 1980 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 HBP1O60381 514 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 HOXC6P09630 235 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 PON1P27169 355 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 FMO5P49326 533 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ODF2Q5BJF6 829 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TINF2Q9BSI4 451 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CCT8L1PA6NM43 557 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 GLRA2P23416 452 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 P3H1Q32P28 736 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 IQSEC1Q6DN90 963 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 RRAGAQ7L523 313 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 IFNL1Q8IU54 200 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SLC35B4Q969S0 331 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ERAP1Q9NZ08 941 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 AIPL1Q9NZN9 384 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC53A6NM62 1247 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TRAPPC3O43617 180 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 LCA5LO95447 670 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CCND1P24385 295 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 EPHB4P54760 987 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SREBF2Q12772 1141 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 CBX3Q13185 183 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 C17orf99Q6UX52 265 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 RAPGEF5Q92565 580 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1586Q9HCI6 787 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 USP20Q9Y2K6 914 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TLR2O60603 784 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 RFX1P22670 979 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ADSSP30520 456 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 SOX10P56693 466 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 RIPK1Q13546 671 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 NFU1Q9UMS0 254 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HOXA3-201ENST00000317201 VAMP7P51809 220 aa15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 361.3 ms