RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	ARG80	P07249	177 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	SGA1	P08019	549 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	URA6	P15700	204 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	CPR2	P23285	205 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	CPR4	P25334	318 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PET18	P25362	215 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ACH1	P32316	526 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	TCA17	P32613	152 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	SEN34	P39707	275 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PRM5	P40476	318 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YIL029C	P40538	142 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YKE4	P40544	346 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	UBX6	P47049	396 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YJL016W	P47072	561 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	SIP18	P50263	79 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	AVT4	P50944	713 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YIP5	P53108	310 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YLR283W	Q05867	314 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YPL272C	Q08984	517 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	INP53	Q12271	1107 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	MCT1	Q12283	360 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	DBF20	P32328	564 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	REC114	P32841	428 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	MRPL36	P36531	177 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	UMP1	P38293	148 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.92	□□□□□ -1.78	not detected
CPR4	YCR069W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	TIR3	P40552	269 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	MOB2	P43563	287 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	BXI1	P48558	297 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YGL159W	P53110	370 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YPL067C	Q02754	198 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YDC1	Q02896	317 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YPR098C	Q06089	161 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	STF2	P16965	84 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PEX4	P29340	183 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	NAT2	P37293	288 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YPC1	P38298	316 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YHL037C	P38733	133 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YER084W	P40057	128 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	RNH201	P53942	307 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PRM15	Q03262	622 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	UPS1	Q05776	175 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	PIN3	Q06449	215 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	GRC3	Q07845	632 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CPR4	YCR069W	GAL1	P04385	528 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PUT1	P09368	476 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ATG22	P25568	528 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRP17	P28778	131 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SIP1	P32578	815 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CLB6	P32943	380 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PPQ1	P32945	549 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MCH2	P36032	473 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YHR122W	P38829	231 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YIL169C	P40442	995 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SLM1	P40485	686 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PHB1	P40961	287 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CAT5	P41735	233 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	EGT2	P42835	1041 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRX5	P47007	382 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SSN8	P47821	323 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YGL260W	P53056	76 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RSM27	P53305	110 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRPL50	P53724	139 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ASI3	P53983	676 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	VBA1	Q04301	562 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	SNA4	Q07549	140 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	RDI1	Q12434	202 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ODC2	Q99297	307 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	ISN1	Q99312	450 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	PET20	Q99373	253 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CPR4	YCR069W	COX5B	P00425	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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