RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	OXER1	Q8TDS5	423 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RMDN3	Q96TC7	470 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM66	O15016	1216 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SNPH	O15079	494 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNAB3	O43448	404 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GJB6	O95452	261 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MARK3	P27448	753 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SP2	Q02086	613 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SCRN1	Q12765	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMD2	Q13200	908 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	INAVA	Q3KP66	663 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD1	Q719H9	257 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	NME8	Q8N427	588 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	HEATR9	A2RTY3	570 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH2	P05091	517 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	NR3C2	P08235	984 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TGFB3	P10600	412 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	DRD1	P21728	446 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ADCY7	P51828	1080 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MKL1	Q969V6	931 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	COL1A2	P08123	1366 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ESPL1	Q14674	2120 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0U1RQF3	1178 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ENC1	O14682	589 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF197	O14709	1029 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TTLL1	O95922	423 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	LDLR	P01130	860 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MCC	P23508	829 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MLLT10	P55197	1068 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	HDAC4	P56524	1084 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-B	Q31612	363 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SNTG2	Q9NY99	539 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	NRP1	O14786	923 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RTN2	O75298	545 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SP4	Q02446	784 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TNK2	Q07912	1038 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TFCP2	Q12800	502 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CLN3	Q13286	438 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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