RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529		C9IYK1	514 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NBN	O60934	754 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RECQL4	O94761	1208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTN1	P12814	892 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PAX3	P23760	479 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ANXA13	P27216	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PRKCI	P41743	596 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CCZ1B	P86790	482 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NCOA4	Q13772	614 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SEPT8	Q92599	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM2	Q99965	735 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ENPP3	O14638	875 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	MGEA5	O60502	916 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CLTB	P09497	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SKIL	P12757	684 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGA4	P13612	1032 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SYN1	P17600	705 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	MFAP3	P55082	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RBP5	P82980	135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	BIRC3	Q13489	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SHC3	Q92529	594 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PHACTR2	O75167	634 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NFIC	P08651	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LRPAP1	P30533	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	STAT1	P42224	750 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LRMP	Q12912	555 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPC3	Q13507	836 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TATDN2	Q93075	761 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	HES2	Q9Y543	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PIR	O00625	290 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRN2	O75325	713 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GFPT2	O94808	682 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMP1	P01033	207 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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