RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASB7Q9H672 318 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACP6Q9NPH0 428 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABRQQ9UN88 632 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CST3P01034 146 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNC2P02585 160 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMEP08473 750 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLT3LGP49771 235 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HADHBP55084 474 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJA9P57773 515 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSTNP61366 133 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NKX3-2P78367 333 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIC1Q14526 733 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIZQ2M2Z5 673 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM192Q8IY95 271 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D8O95759 1140 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF3Q5VWG9 929 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CREG2Q8IUH2 290 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBR7Q8N806 425 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX35Q5T0J7 233 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THAP2Q9H0W7 228 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCK2O43639 380 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAT1P11488 350 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCB4P21439 1286 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYL6P60660 151 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPC3Q13507 836 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF4BQ92750 862 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAXDC2Q96IV6 333 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMS19Q96T76 1030 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.45■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LACTBL1A8MY62 500 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF185O15231 689 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FTCDO95954 541 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITIH3Q06033 890 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG1Q8WTW3 980 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF14Q9UBS8 474 aa23.44■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT4O43236 478 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TREHO43280 583 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRM5P41594 1212 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF132P52740 706 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKCZQ05513 592 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCARA3Q6AZY7 606 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPNS2Q96L46 248 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.43■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CES2O00748 559 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AOC2O75106 756 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFICP08651 508 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPC5P78333 572 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NME8Q8N427 588 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C7orf31Q8N865 590 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYADML2A6NDP7 307 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTA2O94776 668 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AXLP30530 894 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF699Q32M78 642 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM270Q6UE05 265 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD302Q8IX05 232 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.42■■□□□ 1.34
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSMRQ99650 979 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms