RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YIL012W	P40551	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	HXT16	P47185	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	CRZ1	P53968	678 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RSM23	Q01163	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
VBA1	YMR088C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MAK3	Q03503	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RAV2	Q03956	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TEN1	Q07921	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MED11	Q99278	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SOD2	P00447	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ANB1	P19211	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPS1	P32329	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MRP20	P32387	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SFC1	P33303	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SNC2	P33328	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PMU1	P36069	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MRPL28	P36527	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MDM31	P38880	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FMP52	P40008	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YER188W	P40103	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	FAR3	P46671	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MCM22	P47167	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SCS3	P53012	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YIP4	P53093	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	MTM1	P53320	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ASR1	Q06834	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	NUS1	Q12063	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LAS17	Q12446	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	VTH1	P40438	1549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	VTH2	P40890	1549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	AAC1	P04710	309 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	GLN3	P18494	730 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ATG15	P25641	520 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	EMP70	P32802	667 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SRY1	P36007	326 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	not detected
VBA1	YMR088C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SKN7	P38889	622 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	SRT1	Q03175	343 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YHM2	Q04013	314 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ECI1	Q05871	280 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	ASA1	Q06822	443 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	PLB3	Q08108	686 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	GEP3	Q08622	556 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	GPB1	Q08886	897 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	LCB4	Q12246	624 aa		4.96	□□□□□ -1.61
VBA1	YMR088C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ERD1	P16151	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	RPB8	P20436	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	GPI12	P23797	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	THI80	P35202	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	GPX2	P38143	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YBR096W	P38256	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	GEP4	P38812	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YEL075C	P39972	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YER158C	P40095	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YDL186W	P48568	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	MUP1	P50276	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	COX18	P53239	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	CPR8	P53728	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	BSP1	Q06604	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	GPI11	Q06636	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	COX3	P00420	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	PAI3	P01094	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	TPK3	P05986	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SNF5	P18480	905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	GAC1	P28006	793 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	TOA2	P32774	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	TKL2	P33315	681 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SLM6	P38343	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SAF1	P38352	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VBA1	YMR088C	SWM2	P40342	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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