RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W PST1Q12355 444 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W COX5AP00424 153 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YOL163WP0CF20 169 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W ERD2P18414 219 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SFC1P33303 322 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W BRR6P53062 197 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TOS8P53147 276 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W HST4P53688 370 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W ALG9P53868 555 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W DRS2P39524 1355 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W ECM13P38195 257 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YFR045WP43617 309 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W OST3P48439 350 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YDR222WQ04925 415 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W MSA1Q08471 629 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YCL012CQ8J0M4 134 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YPL229WQ99395 206 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W TUS1Q06412 1307 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W DBF2P22204 572 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W SRY1P36007 326 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YER189WP40104 122 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W ECO1P43605 281 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W MIG2P53035 382 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W YPL247CQ12523 523 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR047WYKR047W QCR7P00128 127 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W SEC22P22214 214 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W RNP1P32385 249 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W PEX17P40155 199 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W IRC18P47056 224 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W MDM34P53083 459 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W MRX4Q12467 430 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W AST1P35183 429 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W PRY2P36110 329 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YER034WP40022 185 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W BMT5P40493 336 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W CAT5P41735 233 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W ILM1P47155 203 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W BXI1P48558 297 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W FAR8Q05040 523 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W CDD1Q06549 142 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W EMP46Q12396 444 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W ADE1P27616 306 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W SPS18P32572 300 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W TKL2P33315 681 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W TRM5P38793 499 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YIR035CP40579 254 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W HOP2P53187 214 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W PDR17P53844 350 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YPR063CQ12160 140 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YLR462WO13556 202 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YCR087C-AP37263 153 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W SLX1P38324 304 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YEL075CP39972 122 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YIL059CP40520 121 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W GEP5Q12393 293 aa3.37□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W OAC1P32332 324 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W ERG24P32462 438 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W MSA2P36157 363 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W PFS2P42841 465 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YGL159WP53110 370 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W ERV29P53337 310 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YDR248CQ03786 193 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YLR030WQ07967 263 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W BBP1Q12365 385 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W HTL1Q9URQ5 78 aa3.36□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YHR139C-AO13536 103 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W MET2P08465 486 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W GCN3P14741 305 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W RCN1P36054 211 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
YKR047WYKR047W YML096WQ04489 525 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W INM2Q05533 292 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W GPM2Q12008 311 aa3.35□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W RAD10P06838 210 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W ATP7P30902 174 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W APS1P35181 156 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YIL001WP40560 513 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W FAR7P43592 221 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W RMR1P53060 241 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YML108WQ03759 105 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W YPL257WQ08974 193 aa3.34□□□□□ -1.87
YKR047WYKR047W HIS3P06633 220 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W ECM14P38836 430 aa3.33□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W SGA1P08019 549 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W DSF1P0CX08 502 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W YNR073CP0CX09 502 aa3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKR047WYKR047W RPS23BP0CX30 145 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.9 ms