RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	ECM13	P38195	257 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SUR2	P38992	349 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	BMT5	P40493	336 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	IRC18	P47056	224 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	FAR8	Q05040	523 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	MRX4	Q12467	430 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	CUP2	P15315	225 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SPL2	P38839	148 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	PEX17	P40155	199 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	PRR2	Q12310	699 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.07	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	MET2	P08465	486 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	ATP7	P30902	174 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SPS18	P32572	300 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	TEM1	P38987	245 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	RMR1	P53060	241 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	PDR17	P53844	350 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	OAC1	P32332	324 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SFC1	P33303	322 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	TRR2	P38816	342 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YER189W	P40104	122 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	BXI1	P48558	297 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	MDM34	P53083	459 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	HOP2	P53187	214 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	RSM27	P53305	110 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	DIA1	P54005	336 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SLD7	Q08457	257 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	GPM2	Q12008	311 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	IES3	Q12345	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	EMP46	Q12396	444 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SEC22	P22214	214 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
YJL028W	YJL028W	TRM5	P38793	499 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YIL001W	P40560	513 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	CAT5	P41735	233 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YFR045W	P43617	309 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	HST4	P53688	370 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	PST1	Q12355	444 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	PRY2	P36110	329 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	SLX1	P38324	304 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	FLC3	P53121	802 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	ERV29	P53337	310 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	GRE1	Q08969	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	DNA2	P38859	1522 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YJL028W	YJL028W	DRS2	P39524	1355 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	GCN3	P14741	305 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	RNP1	P32385	249 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ECM4	P36156	370 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	MSA2	P36157	363 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ILM1	P47155	203 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	MIG2	P53035	382 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	YGL159W	P53110	370 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	GEP5	Q12393	293 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	YLR462W	O13556	202 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	APS1	P35181	156 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	YEL075C	P39972	122 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	FAR7	P43592	221 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	MMS2	P53152	137 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	GIM5	Q04493	163 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	AST1	P35183	429 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	MID2	P36027	376 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	MRPL28	P36527	147 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ECO1	P43605	281 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	PET191	Q02772	108 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	YMR279C	Q03263	540 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	ECM11	Q04110	302 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	INM2	Q05533	292 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	SGA1	P08019	549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YJL028W	YJL028W	KSS1	P14681	368 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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