RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	FRM2	P37261	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	NAT2	P37293	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	CHS7	P38843	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YIL024C	P40543	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	COQ5	P49017	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	FLC3	P53121	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	MAK3	Q03503	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	CSN9	Q03981	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TAF2	P23255	1407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	ATS1	P31386	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PMU1	P36069	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	DOG1	P38774	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	XBP1	P40489	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	MAM33	P40513	266 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SDS23	P53172	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PSK1	P31374	1356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	RNQ1	P25367	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YFL064C	P43540	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	ADD37	Q03233	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	ATX2	Q12067	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	MHT1	Q12525	324 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	RIB3	Q99258	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	TRP1	P00912	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	ATR1	P13090	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	DOG2	P38773	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SPL2	P38839	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	GLE2	P40066	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YJL213W	P40896	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	SCS3	P53012	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YGR018C	P53211	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	AYT1	Q12226	474 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG7	YHR171W	DRS2	P39524	1355 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	SCO1	P23833	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	AHC2	P25649	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	PHB1	P40961	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	AAH1	P53909	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	RMI1	Q02685	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	FSH2	Q05015	223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	FCY2	P17064	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	SCO2	P38072	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	RRG9	P40156	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	SNO3	P43544	222 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	MDM32	Q12171	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	CRC1	Q12289	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	PEX2	P32800	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	CPR5	P35176	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	CSG2	P35206	410 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	SFK1	P35735	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	PRY2	P36110	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	POP8	P38208	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	TRR2	P38816	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	HAC1	P41546	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	ERV29	P53337	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	MRPS28	P21771	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	RPR2	P40571	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	NCA3	P46955	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	CDC8	P00572	216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	LDS1	P31379	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	MOH1	P38191	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	MRX11	Q03079	207 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	SHH4	Q06236	168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG7	YHR171W	MSI1	P13712	422 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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