RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	TRM10	Q12400	293 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MHT1	Q12525	324 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	STE7	P06784	515 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YCR022C	P25620	114 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	TRS65	P32893	560 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	APS1	P35181	156 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	GPX1	P36014	167 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	OPY1	P38271	328 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	DOG2	P38773	246 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	DOG1	P38774	246 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	COQ5	P49017	307 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	UBC12	P52491	188 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PRM8	P53174	237 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	HST4	P53688	370 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	MRX11	Q03079	207 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	LIP2	Q06005	328 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YOL160W	Q08321	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	FDH1	Q08911	376 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	ATG22	P25568	528 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PEX34	P25584	144 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YCR101C	P25607	182 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	OAR1	P35731	278 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PEX17	P40155	199 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	XBP1	P40489	647 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	AVT7	P40501	490 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YIL067C	P40514	678 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YNL046W	P53956	172 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	PLP1	Q04004	230 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	SUE1	Q06524	206 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	DAS2	Q12084	232 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SLX8	YER116C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	CDC43	P18898	376 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	AHC2	P25649	128 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PTM1	P32857	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SOL2	P37262	315 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MBA1	P38300	278 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TRR2	P38816	342 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	CHL4	P38907	458 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HAC1	P41546	238 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FAR7	P43592	221 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ARL3	Q02804	198 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SDC1	Q03323	175 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MIM1	Q08176	113 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MSA1	Q08471	629 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SSN2	P38931	1420 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ERD2	P18414	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	URA10	P30402	227 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	PMU1	P36069	295 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	ARN2	P38724	620 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	MAM33	P40513	266 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YGL034C	P53186	121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	TIM8	P57744	87 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FAR10	Q06001	478 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SHH4	Q06236	168 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YPL278C	Q08990	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SIR2	P06700	562 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SNF4	P12904	322 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YCR025C	P25352	136 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FUN26	P31381	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	FMP23	P38231	175 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	SOL1	P50278	321 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	GOT1	Q03554	138 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	YML108W	Q03759	105 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX8	YER116C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87

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