RNA–Protein interactions for RNA: YAL059C-A

YAL059C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YAL059C-A, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAL059C-AYAL059C-A SKM1Q12469 655 aa2.02□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A NAG1Q8TGN9 163 aa2.02□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A OPI3P05375 206 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A RPB3P16370 318 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A FPR1P20081 114 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A RPB8P20436 146 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A CPR4P25334 318 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PBN1P25580 416 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PPA2P28239 310 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A DBF20P32328 564 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SRB6P32570 121 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A NTF2P33331 125 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
YAL059C-AYAL059C-A YKL071WP36086 256 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SDH4P37298 181 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
YAL059C-AYAL059C-A PRS3P38689 320 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A GPI16P38875 610 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
YAL059C-AYAL059C-A FMP10P40098 244 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YIL067CP40514 678 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YIR035CP40579 254 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YFR054CP43622 192 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YGL185CP53100 379 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YGL101WP53144 215 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SMM1P53720 384 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PDR16P53860 351 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A AAH1P53909 347 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A ARL3Q02804 198 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SEN15Q04675 128 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A AIM6Q07716 390 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A RRT7Q07829 113 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MCH4Q08268 501 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A RDR1Q08904 546 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YPL272CQ08984 517 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A BTS1Q12051 335 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A COX19Q3E731 98 aa2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MATALPHA1P0CY06 175 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A HMLALPHA1P0CY07 175 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A HOM3P10869 527 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A NAM2P11325 894 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MAG1P22134 296 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PCL1P24867 279 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PET18P25362 215 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MXR2P25566 168 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2□□□□□ -2.09not detected
YAL059C-AYAL059C-A SCM4P32564 187 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SIP1P32578 815 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MDL1P33310 695 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MRPL36P36531 177 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A AVT5P38176 459 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A ERV15P38312 142 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A COS8P38723 381 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data2□□□□□ -2.09not detected
YAL059C-AYAL059C-A PHO90P39535 881 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PUG1P40100 303 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A VMA21P41806 77 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SMK1P41808 388 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A LOH1P47055 219 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A GPI14P47088 403 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A ASK10P48361 1146 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A BNS1P50084 137 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A PHB2P50085 310 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MPP6P53725 186 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A CRZ1P53968 678 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YCL001W-AP87012 153 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SPC19Q03954 165 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YMR254CQ04838 102 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A SNO4Q04902 237 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MDM30Q05930 598 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A BNA5Q05979 453 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YPR172WQ06608 200 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A BER1Q06688 274 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A POS5Q06892 414 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A HSP33Q08914 237 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A HSP32Q08992 237 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A ODC2Q99297 307 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A FSH3Q99369 266 aa2□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A GAL7P08431 366 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YKR104WP0CE69 306 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A CPR2P23285 205 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A IFM1P25038 676 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A YCR025CP25352 136 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A MGR1P25573 417 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A POF1P25576 258 aa1.99□□□□□ -2.09
YAL059C-AYAL059C-A NAM9P27929 486 aa1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms