RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520728.5

PDP1-208, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDP1, Length 2,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-208ENST00000520728 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 B4GALT5O43286 388 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 EMBQ6PCB8 327 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TMEM270Q6UE05 265 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.38■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CEP120Q8N960 986 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TNFRSF8P28908 595 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 LMAN1P49257 510 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 RUBCNQ92622 972 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MED4Q9NPJ6 270 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.37■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 BRCA2P51587 3418 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MGAMO43451 1857 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CYP2C19P33261 490 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PAK2Q13177 524 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ARMCX2Q7L311 632 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CARD9Q9H257 536 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 FAM189A1O60320 539 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PRKCBP05771 671 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ECHS1P30084 290 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 SNAPC2Q13487 334 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CUL2Q13617 745 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.36■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 DAPK3O43293 454 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 LGR5O75473 907 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ABCD1P33897 745 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 NCOA4Q13772 614 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 IER5Q5VY09 327 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CAVIN3Q969G5 261 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 FAM167AQ96KS9 214 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CGRRF1Q99675 332 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 DPH5Q9H2P9 285 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MROH8Q9H579 483 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 SPOPO43791 374 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CYP1A2P05177 515 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 IQCF3P0C7M6 154 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 RRM1P23921 792 aa20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TOM1L1O75674 476 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 KRT14P02533 472 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PYGMP11217 842 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 FLT3P36888 993 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 MAPK6Q16659 721 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ZNF394Q53GI3 561 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ZIM3Q96PE6 472 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CCDC188H7C350 402 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PEX5P50542 639 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TMEM192Q8IY95 271 aa20.34■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 GLTPD2A6NH11 291 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PDHXO00330 501 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 CD58P19256 250 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ADORA2AP29274 412 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 TTLL4Q14679 1199 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.33■□□□□ 0.85
PDP1-208ENST00000520728 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170 ms