RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOWAHDA6NJG2 315 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBKBP1A7MCY6 615 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA6L22H0YM25 854 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRP1O14786 923 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXTL3O43909 919 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF883P0CG24 379 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRGNP10124 158 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 IMPDH2P12268 514 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 MGAT1P26572 445 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOX8P57073 446 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPRRQ15256 657 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GEN1Q17RS7 908 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF227Q86WZ6 799 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3C3Q8NEB9 887 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GBP4Q96PP9 640 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF20Q9BVI0 1012 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM55Q9BYV6 548 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPC1Q9H2F5 836 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB1Q9Y576 335 aa0.22□□□□□ -2.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR17Q8IZU2 1322 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PQH9 124 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOP56O00567 594 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERN1O75460 977 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 GAAP10253 952 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCSK6P29122 969 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNJ5P48544 419 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSCR10P59022 87 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVFC1-1P60608 527 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 POU5F1BQ06416 359 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPAL2Q16609 132 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFCAB12Q6NXP0 572 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYG1Q8N1E2 194 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5M3Q8NGP4 307 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIB2Q96AX9 1013 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYDC2Q96IM9 177 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMS19Q96T76 1030 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOX7Q9BT81 388 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 IPPKQ9H8X2 491 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 RMI1Q9H9A7 625 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMA5BQ9P283 1151 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MU10 97 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM22K7EJ46 135 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRLF1O75462 422 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOD2P04179 222 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARRB2P32121 409 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR19Q15760 415 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM153CQ494X1 144 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSHZ3Q63HK5 1081 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 COLCA1Q6ZS62 124 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHSY1Q86X52 802 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8NA96 180 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CALML6Q8TD86 181 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB5Q8WWX0 329 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGFBPL1Q8WX77 278 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPIN2Q92539 896 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEUROG1Q92886 237 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED30Q96HR3 178 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC140Q96MF4 163 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB16Q96NS5 453 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 NT5C1AQ9BXI3 368 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDF2L1Q9HCN8 221 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 POGKQ9P215 609 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP25Q9UHP3 1055 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZMYM3Q14202 1370 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 AATKQ6ZMQ8 1374 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 B5MCH6 92 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 JTBO76095 146 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALDH1A2O94788 518 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 DLX5P56178 289 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSD11B2P80365 405 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CATSPEREQ5SY80 951 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF618Q5T7W0 954 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO33Q7Z6M2 555 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIM3Q86V86 326 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZZZ3Q8IYH5 903 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAMKK1Q8N5S9 505 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFAP2CQ92754 450 aa0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms