RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513056.5

FAM53C-211, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53C, Length 923 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-211ENST00000513056 BSNDQ8WZ55 320 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 NELL1Q92832 810 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 GDE1Q9NZC3 331 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CACNA1BQ00975 2339 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 A0A087WWV3 80 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 BTBD18B2RXH4 712 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CYP11B2P19099 503 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ANAPC15P60006 121 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 DCLK2Q8N568 766 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 DEPTORQ8TB45 409 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 KXD1Q9BQD3 176 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 SPTBN2O15020 2390 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 NCAM2O15394 837 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 TRAPPC3O43617 180 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 DTNBO60941 627 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 MED24O75448 989 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 B3GAT3O94766 335 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 MUTP22033 750 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 RPA1P27694 616 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 EFNA5P52803 228 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 PADI6Q6TGC4 694 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 GTF3C6Q969F1 213 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CITO14578 2027 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 LILRB5O75023 590 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 EDN1P05305 212 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 RHOP08100 348 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 SDHBP21912 280 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 TRIM29Q14134 588 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 UPP1Q16831 310 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ERMNQ8TAM6 284 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 DNASE1L2Q92874 299 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 EPC1Q9H2F5 836 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 GDAQ9Y2T3 454 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CLCNKBP51801 687 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 NCDNQ9UBB6 729 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM53C-211ENST00000513056 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.08■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 MICAL2O94851 1124 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ME3Q16798 604 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 NECAB1Q8N987 351 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ING5Q8WYH8 240 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 KIFAP3Q92845 792 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 IFT74Q96LB3 600 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ACACBO00763 2458 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ABLIM3O94929 683 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 COL4A2P08572 1712 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 PTPN2P17706 415 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 CD72P21854 359 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 MCM7P33993 719 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ROR1Q01973 937 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 ADCY1Q08828 1119 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 XKR4Q5GH76 650 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 IER2Q9BTL4 223 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 USP20Q9Y2K6 914 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 TBC1D4O60343 1298 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM53C-211ENST00000513056 LARGE1O95461 756 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms