RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CD302	Q8IX05	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LPAR1	Q92633	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF213	O14771	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MGRN1	O60291	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CLSTN1	O94985	981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MBD4	O95243	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GH2	P01242	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MMP1	P03956	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RAB27A	P51159	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RWDD2B	P57060	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	UBXN2A	P68543	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCNA1	P78396	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ITIH3	Q06033	890 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MOGS	Q13724	837 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LRP8	Q14114	963 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C12orf60	Q5U649	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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