RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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PTX4-201ENST00000293922 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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PTX4-201ENST00000293922 VN1R3Q9BXE9 311 aa19.93■□□□□ 0.78
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PTX4-201ENST00000293922 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.88■□□□□ 0.77
PTX4-201ENST00000293922 TTI2Q6NXR4 508 aa19.88■□□□□ 0.77
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PTX4-201ENST00000293922 EXOC7Q9UPT5 735 aa19.88■□□□□ 0.77
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PTX4-201ENST00000293922 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTX4-201ENST00000293922 CA8P35219 290 aa19.87■□□□□ 0.77
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PTX4-201ENST00000293922 PMS1P54277 932 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
PTX4-201ENST00000293922 STRN3Q13033 797 aa19.87■□□□□ 0.77
PTX4-201ENST00000293922 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
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PTX4-201ENST00000293922 SNTG2Q9NY99 539 aa19.87■□□□□ 0.77
PTX4-201ENST00000293922 STK39Q9UEW8 545 aa19.87■□□□□ 0.77
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