RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 CUL2Q13617 745 aa20.36■□□□□ 0.85
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VBP1-201ENST00000286428 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.36■□□□□ 0.85
VBP1-201ENST00000286428 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VBP1-201ENST00000286428 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.36■□□□□ 0.85
VBP1-201ENST00000286428 KAT5Q92993 513 aa20.36■□□□□ 0.85
VBP1-201ENST00000286428 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.36■□□□□ 0.85
VBP1-201ENST00000286428 TLR10Q9BXR5 811 aa20.36■□□□□ 0.85
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VBP1-201ENST00000286428 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
VBP1-201ENST00000286428 FTCDO95954 541 aa20.32■□□□□ 0.84
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VBP1-201ENST00000286428 MMEP08473 750 aa20.32■□□□□ 0.84
VBP1-201ENST00000286428 STAG3L1P0CL83 205 aa20.32■□□□□ 0.84
VBP1-201ENST00000286428 MYBL1P10243 752 aa20.32■□□□□ 0.84
VBP1-201ENST00000286428 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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