RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	LDB18	Q07887	179 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MRPS28	P21771	286 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SCO1	P23833	295 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	INO2	P26798	304 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	UGX2	P32772	223 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PDC2	P32896	925 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TVP38	P36164	337 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ARN1	P38731	627 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MTC6	P38849	526 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	EGT2	P42835	1041 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	BXI1	P48558	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	UBC12	P52491	188 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	FLC3	P53121	802 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PRM8	P53174	237 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SUR7	P54003	302 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RSC9	Q03124	581 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TSA2	Q04120	196 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	FRE8	Q12209	686 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SSN2	P38931	1420 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	FCY2	P17064	533 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	AVT5	P38176	459 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TRR2	P38816	342 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GLC8	P41818	229 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MOB2	P43563	287 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	AIM25	P47140	327 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	HST4	P53688	370 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ATP23	P53722	227 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	UBC7	Q02159	165 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ARL3	Q02804	198 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YLR030W	Q07967	263 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TIM18	Q08749	192 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YMC1	P32331	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PHD1	P36093	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YHL049C	P38722	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GLE2	P40066	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	COQ5	P49017	307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	COG7	P53195	279 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	IRC15	Q02733	499 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ODC1	Q03028	310 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MAK3	Q03503	176 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	GMC1	Q04399	608 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SPG4	Q04438	115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	THI20	Q08224	551 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YOL160W	Q08321	113 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	ERV2	Q12284	196 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
SMI1	YGR229C	YBR285W	P38354	144 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RCK1	P38622	512 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PEX22	P39718	180 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YNL320W	P42840	284 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YJL043W	P47053	257 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YJR015W	P47090	510 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	TPC1	P53257	314 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YNL184C	P53876	108 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	RUB1	Q03919	77 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YET2	Q04210	160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	SWF1	Q04629	336 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	MSA1	Q08471	629 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	PFA4	Q12006	378 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SMI1	YGR229C	HIS3	P06633	220 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	YCR022C	P25620	114 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	ATG15	P25641	520 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	AHC2	P25649	128 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	AGA1	P32323	725 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	PHA2	P32452	334 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	AEP1	P32493	518 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	YPT53	P36019	220 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	MRP21	P38175	177 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	FMP23	P38231	175 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
SMI1	YGR229C	DOG2	P38773	246 aa		3.09	□□□□□ -1.92

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