RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 FAM167AQ96KS9 214 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NACC1Q96RE7 527 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 CGREF1Q99674 301 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 BRCA2P51587 3418 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 WDR81Q562E7 1941 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 POTEB3A0JP26 581 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 HBP1O60381 514 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 STBD1O95210 358 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PSEN2P49810 448 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 SCNN1BP51168 640 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 TUBA4AP68366 448 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 GRB10Q13322 594 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 DRP2Q13474 957 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 MFSD10Q14728 455 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ECM1Q16610 540 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NXNQ6DKJ4 435 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 POTEBQ6S5H4 581 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 C11orf74Q86VG3 221 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PNMA5Q96PV4 448 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KRT82Q9NSB4 513 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 A0A1W2PQY0 241 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 BIRC5O15392 142 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 MARK3P27448 753 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 LIG3P49916 1009 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 UBE2HP62256 183 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 IGBP1P78318 339 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PRKCEQ02156 737 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ITIH3Q06033 890 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 CBX3Q13185 183 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 TUBA3CQ13748 450 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 HVCN1Q96D96 273 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ABHD8Q96I13 439 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 CTAGE1Q96RT6 745 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 DNM3Q9UQ16 869 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 HPSEQ9Y251 543 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 A0A1B0GVL5 298 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 TTC34A8MYJ7 566 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NDUFAB1O14561 156 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 DMPKQ09013 629 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KAZNQ674X7 775 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 POTEGQ6S5H5 508 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ANO5Q75V66 913 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ESX1Q8N693 406 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 CD248Q9HCU0 757 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 KLC4Q9NSK0 619 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 A0A087X0B3 334 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 COL6A1P12109 1028 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PFKFB1P16118 471 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PLCG1P19174 1290 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 PSMC6P62333 389 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ITGA7Q13683 1181 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 SNCBQ16143 134 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ZNF484Q5JVG2 852 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-201ENST00000351328 SESTD1Q86VW0 696 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms