RNA–Protein interactions for RNA: YJL197W

UBP12, Transcript of Ubiquitin-specific protease, yeast

Gene UBP12, Length 3,765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBP12	YJL197W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SDH3	P33421	198 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MDM31	P38880	579 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PCI8	P40512	444 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	NCA3	P46955	337 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PDR17	P53844	350 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SDC1	Q03323	175 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	RIF2	Q06208	395 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MBA1	P38300	278 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	HEM14	P40012	539 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YJL016W	P47072	561 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	NRM1	P53718	249 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	JID1	Q12350	301 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	BNR1	P40450	1375 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	GIT1	P25346	518 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	DRE2	P36152	348 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	EFM1	P38732	585 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YFL067W	P43537	175 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ERV2	Q12284	196 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	POP7	P38291	140 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
UBP12	YJL197W	YJR056C	P47115	236 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	LIP2	Q06005	328 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	LOA1	Q06508	300 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SIR4	P11978	1358 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PPH21	P23594	369 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	GPX1	P36014	167 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	JAC1	P53193	184 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SPC2	Q04969	178 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	COG3	P40094	801 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	STE7	P06784	515 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ATG15	P25641	520 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ASK1	P35734	292 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	GAB1	P41733	394 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	NRK1	P53915	240 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PUT1	P09368	476 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	PHO80	P20052	293 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MRPL28	P36527	147 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MRPL39	P36533	70 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YKE4	P40544	346 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SNO1	Q03144	224 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ADD37	Q03233	198 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	HNT3	Q08702	217 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MRX4	Q12467	430 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
UBP12	YJL197W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YBR062C	P38239	180 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MIM1	Q08176	113 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	HRT3	Q12347	344 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.16	□□□□□ -1.9	not detected
UBP12	YJL197W	YND1	P40009	630 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	INM2	Q05533	292 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	CPR4	P25334	318 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MGT1	P26188	188 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ATS1	P31386	333 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SHE1	P38200	338 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YER186C	P40101	306 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	IRC24	P40580	263 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	CPR7	P47103	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YJR054W	P47114	497 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MRH4	P53166	561 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	NUP49	Q02199	472 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	NSL1	Q12143	216 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	AGC1	Q12482	902 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YHI9	P38765	294 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YJL213W	P40896	331 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YGR015C	P53208	328 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	SPS18	P32572	300 aa		3.15	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	YFL064C	P43540	174 aa		3.15	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	TOS8	P53147	276 aa		3.15	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ABF2	Q02486	183 aa		3.15	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	ERD2	P18414	219 aa		3.15	□□□□□ -1.9
UBP12	YJL197W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9

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